MspI restriction enzime evidence moderate polymorphism in the second exon of BoLA-DRB3 gene

GIOVAMBATTISTA,G.; DIAZ, S.; RIPOLI, M.V.; DULOUT, F.N.; PERAL-GARCIA, P

Basic and Applied Genetics

Sociedad Argentina de Genetica

Año: 2003 vol. 15 p. 63 - 67

1666-0390

Hasta el momento se han descripto 53 alelos para el exón 2 del gen bovino BoLA-DRB3 mediante la técnica de PCR-RFLP. Con el objetivo de analizar los posibles patrones de restricción para la enzima Mspl presentes en el exón 2 del gene BoLA-DRB3, se obtuvieron todas las secuencias de ADN correspondientes a dicho exón enviadas a la base de datos Genbank. Como resultado se observaron 2 sitios de restricción y 5 patrones diferentes para dicha enzima. Además, los patrones de restricción obtenidos a partir de la digestión del ADB genómico se compararon con los predichos a traves del análisis de las secuencias reportadas en la base de datos. El uso de la enzima Mspl junto con BstYl, HaeIII y Rsal podría ser de utilidad para el reconocimiento de ciertas secuencias que presenten un mismo alelo definido sobre la base de la combinación de los patrones de restricción, es decir, alelos definidos por PCR-RFLP, aumentando de esta manera la eficacia del método de tipificación diseñado por van Eijk et ol. (1992). Aunque el número de patrones detectados por Mspl y BstYl es similar, los patrones de la primer enzima son más faciles de identificar que los de la segunda. Por otra parte, Mspl utiliza el mismo buffer y temperatura de reacción que HeaIII y Rsal, simplicando las digestiones dobles. Finalmente, los costos de la tipificación podrían reducirse.-