Prospección in silico del mecanismo de inhibición de una serie de derivados alquenil-cumarínicos frente a la enzima Taq ADN polimerasa

E. F. BRUNA-HAUPT; GARRO. H. A.; L.J. GUTIÉRREZ; C. R. PUNGITORE

Simposio; XXI SIMPOSIO NACIONAL DE QUÍMICA ORGÁNICA SOCIEDAD ARGENTINA DE INVESTIGACIÓN EN QUÍMICA ORGÁNICA XXI SINAQO; 2017

Las cumarinas consisten en una gran clase de sustancias fenólicas que seencuentran en las plantas y se generan por la fusión de un anillo de benceno y α-pirona.Muchos de estos productos naturales exhiben excepcionales actividades biológicas yfarmacológicas tales como antibióticos, antivirales, anti-tumorales y anticoagulantes. (1)Figura 1. Estructura bidimensional de compuestos con actividad inhibitoria in vitro comprobadaEl motivo de la siguiente presentación se basa en la realización de estudios insilico de Docking Molecular proteína-ligando y Dinámica Molecular sobre un grupo dealquenil-cumarinas frente a un ?target? molecular (enzima Taq ADN polimerasa). Dichosestudios complementan el ensayo de inhibición in vitro realizado anteriormente de unafamilia de 20 cumarinas preparadas en nuestro laboratorio.Luego del acoplamiento de los tres compuestos inhibidores mediante la técnicaDocking proteína-ligando con el sitio activo de la enzima Taq ADN polimerasa I seprocedió al refinamiento estructural mediante el empleo de Dinámica Molecular por unlapso de dos nanosegundos de simulaciones, lo cual arrojo como resultados, que lasinteracciones entre los compuestos 1, 2 y 3, (Fig. 1) frente a Taq ADN polimerasa Ifueron casi las mismas, reflejando similares modos de unión. A su vez se pudo observarque todos los compuestos forman interacciones con las bases nitrogenadas DC111,DG204 y DG205 en la cadena de ADN. Además, se pudo deducir que el núcleo de lacumarina contribuye más que los grupos sustituyentes en el reconocimiento enzimático;Pero ni cumarina, y sus análogos 7-hidroxicumarina y 6-hidroxicumarina han sidocapaces de inhibir la enzima Taq ADN polimerasa (resultados de trabajos anteriores) (2),(3). Es por eso que se propone al grupo penteno en posición seis como potencialfarmacóforo. Por último, Los restos Gln613, Ile614, Leu670, Tyr671, Gln754 e His784serían los responsables de reconocer este tipo de derivados de alquenil-cumarina