SECUENCIACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DEL GENOMA MITOCONDRIAL DE Pomacea megastoma (AMPULLARIIDAE)

PERCUOCO, C.B.; ZANIN, V.D.; FORESTELLO, E.; GUZMÁN, L.B.; MOLINA, S.; BELTRAMINO, A.A.; VOGLER, R.E.

Posadas

Congreso; 4° Congreso Argentino de Malacología (4CAM); 2022

Asociación Argentina de Malacología

El género Pomacea Perry, 1810, está representado por caracoles dulceacuícolas de gran tamaño, conocidos como caracoles manzana. En la Argentina se han informado cinco especies hasta el momento, de las cuales Pomacea megastoma se circunscribe a la cuenca del río Uruguay y puntos específicos del Río de la Plata. Si bien existen estudios sobre la biología y la ecología del género, los datos genéticos son escasos, encontrándose únicamente los genomas mitocondriales de cuatro especies de la familia: Pomacea maculata, Pomacea canaliculata, Pomacea diffusa y Marisa cornuarietis. Con el objetivo de caracterizar el mitogenoma de P. megastoma se realizó la secuenciación del ADN genómico total de un individuo de San Javier (Misiones), a través de Next Generation Sequencing, pair-end sequencing (Illumina). Del conjunto de secuencias obtenidas, se filtraron aquellas del genoma mitocondrial. Éstas fueron ensambladas automáticamente empleando Novoplasty, obteniéndose un mitogenoma de 16386 pb. La anotación de los genes fue realizada empleando los servidores MITOS y mediante alineamientos con los mitogenomas emparentados disponibles. Se identificaron 37 genes, que codifican 13 proteínas, 22 ARNt y dos ARNr. El mayor espaciador intergénico, ARNtPhe - cox3, exhibe un motivo de repetición en tándem de 23(15) pb, consistente con regiones genómicas que pueden conformar estructuras secundarias del tipo tallo-bucle, pudiendo probablemente corresponderse con la región control. Regiones repetidas similares se encuentran en los tres genomas del género disponibles, no obstante, todos difieren en composición y longitud con el de P. megastoma. La presencia de esta región repetitiva puede producir errores en el ensamblado de los reads, por lo que se diseñaron cebadores en las regiones flanqueantes, lo que permitirá una mejor caracterización de esta repetición mediante secuenciación de Sanger. El conocimiento del mitogenoma de P. megastoma constituye el primero para la especie y aporta información relevante para estudios filogenéticos y filogeográficos del grupo.