INVESTIGADORES
GUTIERREZ Lucas Joel
congresos y reuniones científicas
Título:
CARACTERÍSTICAS ESTRUCTURALES Y TERMODINÁMICAS DEL EXOSITIO DE BACE1. UN ESTUDIO DE MODELADO MOLECULAR
Autor/es:
GUTIÉRREZ LUCAS J.; ENRIZ, RICARDO D.; BALDONI, HÉCTOR A.
Reunión:
Workshop; XXVIII CONGRESO ARGENTINO DE QUÍMICA Y 4to WORKSHOP DE QUÍMICA MEDICINAL; 2010
Resumen:
CARACTERÍSTICAS ESTRUCTURALES Y TERMODINÁMICAS DEL
EXOSITIO DE BACE1.
UN ESTUDIO DE MODELADO MOLECULAR.
Gutiérrez L.J. a,
b,
Enriz R.D. a, b y Baldoni
H.A. a, c
a Área de Química
General e Inorgánica, Universidad Nacional de San Luis (UNSL),
Chacabuco
917, 5700 San Luis, Argentina, lucasg@unsl.edu.ar.
b Instituto
Multidisciplinario de Investigaciones Biológicas de San Luis (UNSL, CONICET),
Ejercito de Los Andes 950, 5700 San Luis, Argentina.
c
Instituto
de Matemática Aplicada San Luis (UNSL, CONICET), Ejercito de Los Andes 950,
5700 San Luis, Argentina.
La enfermedad de Alzheimer (EA) es una enfermedad
neurodegenerativa devastadora que afecta a millones de personas en el mundo.
Esta enfermedad afecta entre el 6 y 10 % de humanos de 65 años de edad y casi a
la mitad de personas de más de 85 años.
Numerosos estudios conducen a la hipótesis de la cascada amiloide.
Esta hipótesis establece que la producción de Aβ42 (formado por péptidos
de 38 a 42 aminoácidos) juega un rol crítico en estadios tempranos de la
patología en la EA. Una sobreproducción de Aβ42; una limpieza demasiado
lenta del mismo; o el contacto de este péptido con factores de agregación,
permitiría la formación de agregados, dando lugar a la formación de placas
seniles las cuales pueden iniciar una cascada inmunológica y neurotóxica que
resulta en la manifestación clínica de la EA [1].
Recientemente, se ha reportado el descubrimiento de un bolsillo de
anclaje adicional al sitio catalítico de BACE1 humana denominado exositio que
liga pequeños péptidos en forma tal que no se afecta la ocupación del sitio
catalítico. Los péptidos que anclan en este exositio inhiben la capacidad de
BACE1 de hidrolizar su sustrato proteico natural (APP). Este hallazgo representa
una nueva alternativa farmacológica a la EA.
En un trabajo anterior utilizando técnicas de modelado molecular hemos
descripto la localización del exositio de BACE1 [2] en presencia del
inhibidor polipeptídico Ac-YPYFIPL-NH2[3]. En la Tabla 1 se muestran las principales interacciones entre los residuos
de la enzima y el inhibidor mostrando de esta forma las características
del bolsillo alternativo que posee el receptor. Por otro lado, se realizaron cálculos
de descomposición de energía por residuo (utilizando el paquete Amber) para
comprender que porción del inhibidor contribuye en mayor o menor medida a la energía
de unión. En la Figura 1 se puede
observar que Ile5 y Pro6 son los aminoácidos con menor contribución a la
energía de unión. Estos resultados sugieren que la modificación en los residuos
mencionados en la secuencia del inhibidor, mejoraría notablemente la energía de
unión a su receptor.
Referencias
1.
M. Citron; Neurobiology of Aging 23, 10171022,
2002.
2.
L.J. Gutiérrez, R.D. Enriz y H.A. Baldoni; XVI Congreso
argentino de fisicoquímica y química inorgánica, Salta mayo 2009.
3.
M.G. Kornacker, et al. ;
Biochemistry 44, 11567-11573, 2005.