Secuenciación de nueva generación (metabarcoding) en heces de armadillos: ¿qué información nos aporta?

SERVIAN, A.; EZQUIAGA, M.C.; PAGNUTTI, N.; RIOS, TATIANA A.; PANISSE, G.; VERCELLINI, C.; ABBA, A.M.; STENSVOLD, C.R.

Puerto Iguazú

Jornada; XXXIII Jornadas Argentinas de Mastozoologia; 2022

SAREM

La secuenciación de nueva generación permite abordar integralmente datos masivos a partir de una única muestra y en un solo ensayo. Nuestro objetivo fue aplicar esta tecnología para analizar la composición gastrointestinal de cinco ejemplares de armadillos: dos peludos (Chaetophractus villosus: CVI37 y 38), dos piches llorones (C. vellerosus: CVE39 y 40) y una mulita pampeana (Dasypus hybridus septemcinctus: DHY41) procedentes de un campo de Pipinas, Punta Indio, Buenos Aires. Para ello, se extrajo ADN con el kit Stool (PB-L) de heces colectadas directamente de los ejemplares al capturarlos. Las regiones del gen 16S y 18S se amplificaron con cebadores universales y se secuenciaron en el equipo MiSeq (Illumina Inc). En total se registraron 204 taxa pertenecientes a 25 Phyla. La muestra con mayor diversidad de taxa secuenciados pertenece a la mulita con 147 taxa, seguida por el peludo CVI37 con 83. Los piches tuvieron 4 y 5 taxa cada muestra y el peludo CVI38 solo dos. Los diferentes taxa detectados se clasificaron en grupos en función de la información que aportan: dieta, ambiente, parásitos y tracto gastrointestinal, siendo los más representados bacterias, hongos y protozoos ambientales (n=84), especialmente del suelo (n=57, ej. Acetivibrio, Preussia, Westerdykella), seguido por el agua (n=26, ej. Lactococcus, Sorogena, Tetramitus) y un taxón presente en el aire (Cladosporium). El grupo que le sigue en diversidad son bacterias del tracto gastrointestinal (n=76, ej. Bacteroides, Parabacteroides, Alloprevotella, Fusobacterium), luego aparecen los taxa de la dieta (n=34, ej. artrópodos) y parásitos propios (n=11, ej. Eimeria). De los taxa reconocidos, 14 son zoonóticos o tienen el potencial de serlo (ej. Ancylostoma, Blastocystis, Diplorickettsia, Strongyloides). Esta tecnología permitió, a través de un enfoque integral, conocer diversos aspectos de la biología y ecología de los armadillos a partir de una única muestra de heces.