Microbioma ruminal en vaca fresca bajo TMR con distintos niveles de almidón y tipo de carbohidratos: nivel Phylum

MICCOLI, F; JUIANO, N; GUERRERO, LEANDRO; WEHRENDT D. P; ERIJMAN, LEONARDO

Congreso; Congreso de la Asociación Argentina de Producción Agropecuaria; 2022

NA 48 Microbioma ruminal en vaca fresca bajo TMR con distintos niveles de almidón y tipo de carbohidratos: nivel PhylumMiccoli F.E.1,2*, Juliano N.2,4, Guerrero L.3, Wehrendt D.3, Erijman L.3, Colombatto D.2,4, Fernández-Martin R.2,4, Galarza R.5 y Palladino, R.A.1,41Facultad de Cs. Agrarias, UNLZ. 2Facultad de Agronomía, UBA. 3INGEBI, CONICET. 4INPA, CONICET, 5INTA Cuenca del Salado.*E-mail: fmiccoli@agro.uba.arRumen microbiome in fresh dairy cows fed with TMR differing in starch level and type of carbohydrates: phylum levelNutrición y Alimentación Animal 45º Congreso Argentino de Producción AnimalREVISTA ARGENTINA DE PRODUCCIÓN ANIMAL VOL 42 SUPL. 1: 281-329 (2022) 329IntroducciónEl estudio de las relaciones entre las abundancias relativas (RA) de los principales taxones del microbioma ruminal y las variables productivas permite una mejor explicación del comportamiento de las respuestas en el animal. La composición microbiana puede ser el resultado de factores dietarios, del propio individuo o de ambos. El objetivo de este estudio fue analizar posibles asociaciones de los Phylum dominantes del rumen de vacas frescas con las variables productivas y los niveles sanguíneos de dos proteínas de fase aguda, ceruloplasmina y haptoglobina.Materiales y MétodosSe utilizaron 19 vacas lecheras consumiendo una dieta TMR 50:50 MS de silaje de planta entera de maíz y pellet a base de grano de maíz (MZ; maíz 45%, expeler de soja 33,8%, cascarilla de soja 16,9%, urea 1,5%, carbonato de Ca 1,1%, sulfato de Mg 0,5%, sal 1%, núcleo vit-min 0,2%) o cascarilla de soja (CS; maíz 20,3%, expeler de soja 30,4%, cascarilla de soja 45%, urea 1,4%, carbonato de Ca 1,1%, sulfato de Mg 0,6%, sal 1%, núcleo vit.-min. 0,2%). Las dietas fueron isoproteicas (16% PB), y ajustadas para alcanzar un porcentaje de almidón de 28 y 22% para MZ y CS, respectivamente (Juliano et al., 2020). Se extrajo contenido ruminal de cada animal por técnica del tubo oro-ruminal adaptada para muestreos de microbioma (Miccoli et al., 2020) entre el día 4 al 11 postparto (medición del pH con Hanna HI98128 pHep® 5 Waterproof), el cual se trasvasó a tubos de espécimen de 50 ml para almacenaje a -80°C. Se extrajo ADN genómico siguiendo el protocolo de extracción y purificación del kit ADN PuriPrep-SUELO (Inbio Highway Biología Molecular, Argentina). La concentración de ADN se cuantificó por lectura en Nanodrop 1000 spectrophotometer. La calidad del ADN fue evaluada mediante electroforesis a 120V durante 50 min, con una corrida de 120 ng de muestra en un gel de agarosa al 2%. Se seleccionaron 15 de las 19 muestras por concentración e integridad del ADN (CS=8 y MZ=7) y fueron secuenciadas en Novogene (Novogene Corporation Inc., China), previa amplificación por PCR de la región V4 del 16S rRNA del ADN de bacterias y archaeas para generar las librerías de amplicones y luego la secuenciación. La plataforma utilizada fue NovaSeq PE250. Los resultados fueron analizados con los programas DADA2 y Phyloseq del paquete estadístico R, que permite analizar a nivel de ASV (100% Identity). Luego de este análisis, se calcularon las RA a nivel Phylum. De las variables productivas reportadas previamente (Juliano et al., 2020), se tomaron los datos entre los días 4 al 10 posparto. Brevemente, el consumo de materia seca (CMS) se cuantificó diariamente por diferencia entre oferta y remanente, la produccion lechera (PL) se cuantificó diariamente con lactómetros y la composición química de la leche con equipo MilkoScan. Para las concentraciones deceruloplasmina y haptoglobina en sangre (día 4 y 7 posparto, luego del ordene AM) se utilizaron kits turbidímetros (Ceruloplasmin turbitest AA; Haptoglobin turbitest AA Wiener Lab., Rosario, Argentina). Se realizó un análisis de correlación entre estas variables y las RA de los Phylum dominantes, utilizando el programa Infostat.Resultados y DiscusiónSe obtuvo una correlación positiva entre la RA de Bacteroidetes y el CMS 4-10 d posparto (P