Generación de una herramienta para la búsqueda de metadata asociada a transcriptos

MACHADO, RODRIGO; MOSCHEN, SEBASTIAN; GONZÁLEZ, SERGIO ALBERTO; CONTI, GABRIELA; MASSARO, MORA; DI RIENZO, JULIO ALEJANDRO; BURDYN, LOURDES; HOPP, HORACIO ESTEBAN; FERNANDEZ, PAULA

Congreso; 50 CONGRESO ARGENTINO DE AGROINFORMATICA (JAIIO); 2021

Al analizar un transcriptoma en primera instancia se debe realizar unpre-procesamiento computacional de las lecturas de transcriptos generados porsecuenciadores masivos y posterior obtención de la expresión diferencial de losgenes asociados a muestras control y tratadas. Los genes cuantificados deben sercaracterizados con el fin de obtener toda la información posible de la secuenciadel genoma, para luego ser anotados funcionalmente. En ese sentido, el desarrollode un buscador de metadata asociada a cada lectura de manera personalizada paracada experimento y/o especie conlleva grandes ventajas. A la hora de procesarlos datos, a partir del nombre del gen o secuencia puede obtenerse, por ejemplo,la descripción de la proteína, los términos GO, vías de Uniprot, así como resúmenes sobre las categorías funcionales. En el presente trabajo, se utilizó comopunto de partida una tabla de expresión diferencial obtenida a partir del procesamiento bioinformático de la colección biológica PRJNA417324 y mediante latécnica de raspado web, empleando el programa Beautiful Soup, se obtuvo metadata asociada para cada transcripto a partir de la base de datos UNIPROT