Algunos aspectos de la dinámica de los motores moleculares KIF1A

J. SPARACINO; P. W. LAMBERTI; C.M.ARIZMENDI

Granada

Seminario; Seminario del grupo de Física Atómica. Facultad de Ciencias. Universidad de Granada; 2012

Departamento de Física Atómica, Molecular y Nuclear. Instituto Carlos I de Física Teórica y Computacional. Universidad de Granada

  Las cantidades provenientes de Teoría de la Información proveen herramientas útiles para la caracterización de secuencias simbólicas [1]. En este seminario se comentara un trabajo en el que  la divergencia de Jensen-Shannon se utiliza para estudiar secuencias simbólicas binarias que representan el estado estacionario de un modelo de gas de red que describe el tráfico de los motores moleculares KIF1A [2]. Estos motores moleculares son monómeros que pertenecen a la familia kinesina y su función biológica es el tranporte de cargas en el interior de las células eucariotas. Se ligan a los microtúbulos y avanzan de forma dirigida hacia uno de sus extremos. A menudo un mismo filamento es utilizado simultáneamente por un gran número de motores moleculares, en tales circunstancias la interacción entre los motores da lugar a problemas en el transporte intracelular.   El modelo para el tráfico de KIF1A [3] presenta algunos regímenes estacionarios con coexistencia de fase, es decir con regiones donde la densidad de motores es baja y regiones donde la densidad es alta. A partir de la divergencia de Jensen-Shannon, desarrollamos un método de análisis que nos permite identificar los casos en que ocurre coexistencia de fase y para dichos casos, localizar la posición de la interfase que separa las regiones con diferente fase.   En el seminario se da dará una breve introducción a qué son y cómo se mueven los motores moleculares KIF1A, se presentará el modelo y las herramientas de Teoría de la Información que se utilizaron para el método de análisis y finalmente se discutirán los resultados encontrados. Referencias:[1] I.Grosse, P.Bernaola Galván, P.Carpena, R.Román-Roldán, J.Oliver, and H.E.Stanley, Phys. Rev. E 65, 041905 (2002).[2] J.Sparacino, P.W.Lamberti, C.M.Arizmendi, Phys. Rev. E 84, 041907 (2011). [3] K.Nishinari, Y.Okada, A.Schadschneider, and D.Chowdhury, Phys. Rev. Lett. 95, 118101 (2005).