Evaluación del gen del factor de elongación 1 alfa (ef1-alfa) como marcador filogenético de especies del género Escovopsis

MARFETAN, JORGE ARIEL; CAFARO, MATIAS J.; FOLGARAIT, PATRICIA J.

Buenos Aires

Congreso; XIII Congreso Argentino de Micología; 2014

Asociación Micológica Spegazzini

Evaluación del gen del factor de elongación 1 alfa (EF1-alfa) como marcador filogenético de especies del género Escovopsis. Marfetán J 1, Cafaro, M2, Folgarait P1 1-Laboratorio de Hormigas, Departamento de Ciencia y Tecnología, Universidad Nacional de Quilmes, Bernal, Buenos Aires, Argentina. 2-Department of Biology, University of Puerto Rico, Mayaguez, PR 00681, USA. INTRODUCCIÓN Escovopsis es un género de hongos mitospórico (anamorfo) del Orden Hypocreales. Este género cuenta actualmente con 5 especies formalmente descriptas (E. weberii, especie tipo del género, E. aspergilloides, E. lentecrescens, E. microspora y E. moelleri). En la bibliografía se pueden encontrar diversos trabajos en los cuales utilizan el gen del factor de elongación nuclear 1 alfa (EF1-alfa) como marcador molecular para evaluar si ciertos aislamientos pertenecen al género Escovopsis. En este trabajo se analizaron filogenéticamente secuencias de cepas de Escovopsis obtenidas por nosotros las cuales fueron identificadas a partir de sus características morfológicas como E. weberii y E. aspergilloides y dos cepas que se proponen como nuevas especies del género (E. rosaceus y E. catenovesicularis), junto con secuencias disponibles en genbank con el objetivo de evaluar si el gen EF1-alfa es útil como un marcador filogenético para este género. MATERIALES Y MÉTODOS El DNA genómico de las cepas de Escovopsis, fue extraído mediante la técnica de CTAB y cuantificado utilizando un nanodrop. La integridad del ADN se evaluó mediante electroforesis en gel. El ADN fue amplificado utilizando los primers EF1-3F y EF1-5R y los productos obtenidos fueron purificados y secuenciados. Las 19 secuencias obtenidas, junto a 267 obtenidas de genbank, fueron alineadas con el programa MEGA 5. La reconstrucción filogenética se realizó mediante el método Maximum Likelihood basado en un modelo General Time Reversible así como con Maximum Parsimony ambas con un bootstrap basado en 500 réplicas. RESULTADOS Y DISCUSIÓN Los análisis filogenéticos basados en el EF1-alfa no generaron resultados robustos. En las filogenias obtenidas se pudo observar, por un lado, nodos con valores de boostrap muy bajos (menores a 50%) y por otro, que las secuencias del género Escovopsis -las cuales son monofiléticas- fueron agrupadas de forma parafilética, y en algunos casos asociadas a otros géneros poco relacionados con el género Escovopsis. Otro problema considerable que mostró este marcador a la hora de agrupar las especies es que no las pudo separar en clados bien definidos, mezclando dentro de un mismo clado distintas especies, lo cual no sucede en trabajos de otros autores con marcadores como LSU o ITS. CONCLUSIONES El EF1-alfa aparenta no ser lo suficientemente informativo como para resolver correctamente las diferencias entre especies e incluso entre géneros. Se concluye que este marcador no es el ideal para realizar inferencias filogenéticas dentro del género Escovopsis a pesar de la gran cantidad de información disponible en genbank.