VIGILANCIA ACTIVA DE VARIANTES DE SARS-COV-2 EN ROSARIO Y SUR DE LA PROVINCIA DE SANTA FE

PABLO E. CASAL; AGUSTINA CERRI; ELISA M. BOLATTI; VICTORIA POSNER; JULIAN ACOSTA; LUCIA MORIENA; EDUARDO CODINO; M. B MARTI; A. ASUETA; L. VILLAREAL; A. PONZI; C. BOGADO; L. PORFIRI ; P. DIAZ VIÑUELA ; M. BRODÓN; M. BALSEIRO; JAVIER SFALCIN; A. SERAVALLE ; M. GALIZZI; CLARA FAY; M. FAY; F. MASCALI; SILVIA ARRANZ; FABIAN FAY; ADRIANA A. GIRI

Congreso; XIII Congreso Argentino de Virología 2021; 2021

Desde diciembre de 2020, las variantes del SARS-CoV-2 han impulsado las nuevas olas de la COVID-19 a nivel mundial. La OMS ha definido variantes de preocupación (VOC) y variantes de interés (VOI), en base a la aparición de mutaciones no sinónimas en el gen Spike (S) del virus y sus implicancias en la biología viral. Entre las VOC más relevantes se ha descripto las Alfa, Beta, Gama y Delta, detectadas inicialmente en Reino Unido, Sudáfrica, Brasil e India, respectivamente. Con el objetivo de realizar vigilancia activa de las variantes circulantes en el sur de la provincia de Santa Fe se realizaron muestreos en la ciudad Rosario y en 31 localidades de la región. Para conocer las variantes de circulación comunitaria, del total de diagnósticos positivos para SARS-CoV-2 se seleccionaron 5-11% por semana epidemiológica (SE), excluyendo muestras de individuos infectados en viajes al exterior y sus contactos estrechos. La secuenciación parcial del gen S de SARS-CoV-2 se realizó con el protocolo adaptado del CDC y metodología Sanger, siguiendo las recomendaciones del Proyecto PAIS. Para el período comprendido entre el 16/5 al 31/8/2021 (SE 20 a 34) se obtuvieron 552 secuencias parciales del gen S y se identificaron las mutaciones marcadoras que permitieron inferir la siguiente asignación de variantes de SARS-CoV-2: 457 secuencias correspondieron a la variante Gama (82,8%), 68 a la VOI Lambda (12,3%) y 27 a Alfa (4,9%). Ninguna de las secuencias analizadas correspondió a variantes de la primera ola de SARS-COV-2 del año 2020, indicando su reemplazo por las variantes de la segunda ola. Teniendo en cuenta la eminente circulación comunitaria de la variante Delta en nuestro país y/o de nuevas variantes virales, es fundamental continuar con la vigilancia activa en Santa Fe hasta la resolución de la pandemia por SARS-COV-2. Financiamiento: Covid Federal (SF-11), Proyecto PAIS, CIBIC Laboratorios y Subsecretaría de Proyectos Científicos y Tecnológicos de la Provincia de Santa Fe.