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Se investigó la relación entre la riqueza de las comunidades bacterianas y algunos factores ambientales en 6 sitios del Río Suquía (Córdoba, Argentina) con diferente grado de contaminación, seleccionados sobre un tramo de aproximadamente 100 km. Un sitio ubicado 18 km aguas arriba de la ciudad de Córdoba (sitio 1), 3 sitios dentro de la ciudad (entrada: sitio 2, centro: sitio 3 y salida de la ciudad: sitio 4), un sitio 12 km aguas abajo de la planta de tratamiento de líquidos cloacales de Córdoba (sitio 5) y un sitio 50 km aguas abajo de la ciudad (sitio 6). En cada sitio se tomaron 5 muestras de agua, sedimentos y suelo de ribera, en las épocas de bajo y alto caudal del río. En cada muestra se determinó el pH, la conductividad eléctrica, el contenido de C orgánico, de nitratos y de amonio. En los sedimentos y suelos se analizó también el contenido de N total, la humedad y la textura; y en el agua el O2 disuelto. Para analizar la riqueza de las comunidades microbianas las muestras fueron combinadas para obtener una sola muestra de agua, sedimentos y suelo por sitio de estudio y época. A partir de las muestras se extrajo el metagenoma ambiental y se realizaron análisis de PCR-RFLP (reacción en cadena de la polimerasa-polimorfismo de fragmentos largos de restricción) del gen 16S ARNr con la enzima AluI y HaeIII. La riqueza bacteriana se determinó por el número de bandas. Se realizaron correlaciones de Pearson, Mantel y Spearman y análisis de componentes principales. La riqueza bacteriana presentó correlación significativa positiva con el contenido de C orgánico en agua y negativa con el contenido de C orgánico en el suelo (mayor riqueza en sitios 4 y 5; menor riqueza en sitio 1). En el agua la mayor riqueza se debería a que el río en su recorrido recibe efluentes de diferentes fuentes y detritos de la vegetación circundante que aportarían nuevas especies. Por otro lado, la mayor riqueza observada en los suelos pobres en C orgánico puede deberse a dos factores: a) que el agua actúe como inóculo aportando continuamente poblaciones bacterianas al suelo, y b) que el bajo contenido de C orgánico del suelo favorezca la creación de varios nichos permitiendo la coexistencia de diversos grupos microbianos. La falta de asociación entre riqueza y factores ambientales en los sedimentos podría deberse a su heterogeneidad dentro de cada sitio. De acuerdo a estos resultados el C orgánico es el factor ambiental más importante que afecta la riqueza de las comunidades bacterianas aunque de forma diferente en agua y suelo.

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