Análisis Factorial Múltiple para identificación de asociaciones entre caracteres fenotípicos cualitativos y marcadores moleculares

LAC PRUGENT VERÓNICA; COSTA TÁRTARA SABRINA MARÍA; CURTI, RAMIRO; BRAMARDI SERGIO D.

Encuentro; XXV Reunión Científica del Grupo Argentino de Biometría Modalidad virtual.; 2020

El mantenimiento y evaluación del material conservado en Bancos de Germoplasma son etapas indispensables para su posterior aprovechamiento. En los últimos años la caracterización agronómica y morfológica de recursos fitogenéticos se está complementando con caracterización molecular. Para contribuir a los procesos de mejora genética se espera establecer relaciones entre la caracterización agronómica-morfológica (fenotipo) de un conjunto de accesiones conservadas en un banco de germoplasma con la caracterización molecular (genotipo). En el presente trabajo, se caracterizaron 25 accesiones de quínoa nativas del Noroeste Argentino, a través de 11 variables cualitativas y 313 variables correspondientes a marcadores moleculares. Se recurrió a la técnica de Análisis Factorial Múltiple (AFM) para representar la relación entre ambas caracterizaciones. Este análisis realiza un Análisis de Correspondencias para cada grupo de variables y se define una configuración de consenso, diagonalizando la matriz yuxtapuesta, previa ponderación por el inverso del primer valor propio de cada una de las tablas que la conforman. A partir de los resultados del biplot de los dos grupos de variables cualitativas y moleculares, se observaron las posibles Asociaciones, y se realizaron test chi cuadrado para testear su significancia. Se encontraron asociaciones significativas para el color de las estrías (verde, principalmente), la presencia de ramas y la posición de las ramas con la categoría sin ramas. Estos caracteres fenotipos diferenciaron a la colección estudiada con el grado de domesticación de las accesiones. Se prevé realizar, para las asociaciones significativas, modelos de mapeos asociativos. Los análisis se realizaron con el software R.