FlowDiv: uma nova ferramenta computacional para a análise da diversidade citométrica.

SILVA WANDERLEY B.M.; AMORIM DE ARAÚJO D.S.; QUIROGA M.V.; AMADO A.M.; DORIA NETO A.D.; SARMENTO H.P. ; UNREIN F.

Rocha

Taller; 1er Taller de la Red colaborativa en Ecología Microbiana Acuática en América Latina (µSudAqua).; 2017

CURE Centro Universitario Regional del Este, Uruguay

Equilibrar a racionalidade matemática com a epistemologia biológica são condições sine quibus non para qualquer estratégia de análise válida e potencialmente bem sucedida em citometria de fluxo (CMF). Métodos dedicados à análise da diversidade citométrica (i.e. à descrição quali-quantitativa das propriedades intra e inter citogramas) são exemplos singulares dessa premente exigência: conquanto venham divisando notáveis resultados quanto à implementação e avaliação crítica de protocolos, suas disseminações são ainda obstaculizadas por acaloradas discussões de cunho logístico - em especial, questões sobre o modelo matemático mais adequado ao tratamento de dados ambientais, o significado biológico pos hoc das análise e a melhor estratégia de normalização dos dados disponíveis, ainda constituem pontos insuficientemente esclarecidos nos debates. Neste trabalho, propomos soluções formais para essas questões através da implementação de uma pipeline simples, intuitiva e gratuita dedicada à análise de dados de citometria de fluxo ambiental ? o flowDiv. Essa é uma pipeline implementada em linguagem R e estruturada em dezenove fases de processamento e onze etapas de decisão orientada que visam, de forma sequencial e sistemática, tanto à redução da subjetividade analítica quanto à ênfase nos aspectos mais práticos de CFM ambiental. O flowDiv está organizado sob a forma de pacote e encontra-se gratuitamente disponível em https://cran.r-project.org/package=flowDiv.