Análisis filogenético y de coalescencia de AcPV1, un tipo potencial de Gama-Papilomavirus identificado en un mono aullador (Alouatta caraya) salvaje del NEA.

BADANO, I.; BOLATTI E.M; SANCHEZ-FERNANDEZ, C; CHOUHY D; CULASSO ACA; STELLA E.J; LIOTTA, D.J; GIRI A.A; KOWALEWSKI, M; CAMPOS, R

Jornada; XXXVI Reunión Científica Anual de la Sociedad Argentina de Virología; 2016

Los papilomavirus (PVs) son virus con genoma de ADN doble hebra circular (8Kb) que infectan una amplia variedad de vertebrados. El modelo de evolución propuesto para los PVs contempla una baja tasa de sustitución nucleotídica (10-7 a 10-9), ausencia de recombinación y de salto entre espe-cies, características en conjunto denominadas ¨evolución ligada al huésped¨. Sin embargo, varios autores indican que las filogenias obtenidas dentro del linaje de PV de primates son incongruentes con este modelo de co-especiación. Como agravante, los estudios de infección por PV en platirrinos (monos del nuevo mundo) son escasos. El objetivo de este trabajo fue investigar las relaciones filogenéticas entre el fragmento 350 nt del gen L1 (AcPv1) identificado por nuestro grupo en un hisopado oral de un ejemplar salvaje de Alouatta caraya del nordeste Argentino (Corrientes) y evaluar la hipótesis de co-especiación (hués-ped/hospedador) en el linaje de los primates mediante árboles cruzados (Tangled Trees) de PV y ADN mitocondrial primate (CitB). Métodos: La filogenia de PV se construyó a partir de 52 secuencias de proteínas (97 aminoácidos de L1), incluyendo los géneros de monos Catarrinos (viejo mundo): Pan (n: 11), Gorilla (n: 4), Macaca (n: 26), Colobus (n: 1), Homo (n: 7, Gama-HPVs) y de Platirrinos: Ateles (n: 1), Saimiri (n: 1) Alouatta (n: 1). Las filogenias de CitB, se construyeron a partir de secuencias de ADN (293 nt.) incluyendo a los géneros catarrinos: Pan (n: 1), Gorilla (n: 1), Pongo (n: 1), Colobus (n: 1), Macaca (n: 1), Homo (n: 1); Platirrinos: Alouatta (n: 26), Cebus y Sapajus (n > 60), Saimiri (n: 1) y em-pleando Varecia (n: 1) y Tarsius (n: 1) como grupo externo. Todas las secuencias estaban disponi-bles en GenBank o fueron determinadas por nuestro grupo (CitB=30; AcPV1=1). Los análisis de coalescencia (edad del Ancestro Común Mas Reciente, ACMR) y filogenia fueron realizados con Beast. La hipótesis de co-especiación fue testeada con TreeMap. Resultados: La topología general del árbol de CitB fue un reflejo de las relaciones taxonómicas en-tre los primates estudiados (patrones monofiléticos y jerárquicos entre géneros). Como contraparte la filogenia de los PVs no presentó patrones monofiléticos ni jerárquicos para ninguno de los géneros de primates. La secuencia de AcPV1 (Alouatta) se agrupó junto con virus aislados de los géneros Pan y Macaca (monos del viejo mundo). Los HPVs tampoco fueron monofiléticas, sino que se encontraron mezcladas en clusters integrados por a monos del viejo y del nuevo mundo. La prueba de Tangled Trees descartó la hipótesis nula de co-especiación (α=0,01). El análisis de coalescencia indicó que la edad del ACMR para los PVs fue de 45.000.000 de años, fecha que coincide con la divergencia de catarrinos y platirrinos durante el eoceno.Conclusión: Nuestros resultados ofrecen un marco temporal factible para la radiación adaptativa de un ancestro de los PVs en el linaje de los primates pero cuestionan la hipótesis de co-especiación como principal fuerza directriz de la evolución viral. Intensificar la búsqueda de PV en primates no humanos permitirá comprender cuestiones fundamentales sobre la patogenia, la epidemiología, el origen y la evolución de estos virus.