Estructura de las comunidades bacterianas urogenitales en cerdas jóvenes

TORRES LUQUE, ANDREA; MONTEROS, GIULIANA ROCÍO; FONTANA, C.; CIZEK, CAROLINA; PASTERIS S. E.;; OTERO, M.C.

Tafí del Valle-Tucumán

Jornada; XXXIX Jornadas Científicas Asociación de Biología de Tucumán.; 2022

Asociación de Biología de Tucumán.

Las microbiotas residentes en vagina (V) y uretra (U) interactúan con la mucosa urogenital y pueden direccionar la sanidad y performance reproductiva de las cerdas. El objetivo de este trabajo es evaluar la estructura de las comunidades bacterianas de V y U de cachorras sanas de un establecimiento extensivo de Tucumán. Se tomaron muestras por raspado de V y U; a partir del ADN total extraído, se amplificó la región bacteriana V3-V4 del ARNr 16S (cebadores 343F y 802R); los productos fueron secuenciados (MiSeq Illumina), analizados (QIIME) y las unidades taxonómicas operativas (OTU) se identificaron por comparación con secuencias de referencias (Greengenes y NCBI-Blast). Se utilizó la plataforma Microbiome Analyst y se calcularon los índices Chao1, Shannon y de similaridad de Bray-Curtis. La riqueza, α diversidad (Mann-Whitney/Kruskal–Wallis, p>0,05) y β diversidad (PERMANOVA, p>0,05) de U y V fue similar. Los filos Firmicutes, Proteobacteria, Actinobacteria y Bacteroidetes se detectaron en el 90% de las muestras; los dos primeros fueron los más abundantes. Se identificaron 53 familias, las más abundantes: Tissierellaceae, Lactobacillaceae, Fusobacteriaceae y Clostridiaceae. Los géneros con abundancias >5% fueron: Lactobacillus, Fusobacterium y Parvimonas. No se detectaron diferencias entre U y V para las poblaciones más abundantes (Mann-Whitney/Kruskal–Wallis, p>0,05). Las microbiotas de V y U tienen una estructura similar, con poblaciones bacterianas comunes en ambos nichos. Estos hallazgos permiten asumir que se trataría de una única “microbiota urogenital” que debe ser tenida en cuenta como tal, en el diseño de estrategias biotecnológicas de manejo reproductivo.