TDR Targets: identificación y priorización computacional de blancos para el desarrollo de drogas contra patógenos humanos.

AGÜERO F, BERRIMAN M, BUCKNER F, CARMONA S, CROWTHER G, HERTZ-FOWLER C, NWAKA S, PAIN A, RALPH SA, RIECHERS A, ROOS DS, SHANMUGAM D, SUZUKI T, VERLINDE CL, VAN VOORHIS WC.

Chascomús, Buenos Aires, Argentina

Congreso; XXII Reunión Anual, Sociedad Argentina de Protozoología.; 2007

Sociedad Argentina de Protozoología

Las drogas existentes contra enfermedades tropicales asociadas a la pobreza (desatendidas) son pocas y generalmente inadecuadas debido a su eficacia limitada, toxicidad y/o desarrollo de resistencia. Se necesitan nuevas drogas con urgencia. La disponibilidad reciente de las secuencias genómicas de cinco patógenos humanos causantes de enfermedades desatendidas (Plasmodium falciparum, Mycobacterium tuberculosis, Trypanosoma brucei, Leishmania major y Trypanosoma cruzi),y la próxima aparición de los genomas de helmintos parásitos (Schistosoma mansoni, Brugia malayi, Onchocerca) ha creado una oportunidad única para identificar potenciales blancos para el desarrollo de nuevas drogas. Para aprovechar la información genómica disponible estamos desarrollando una base de datos (TDR Targets) con el objetivo de ayudar en la búsqueda de potenciales nuevos blancos. Esta herramienta computacional permite priorizar genes mediante búsquedas sobre la base de datos utilizando criterios fijados por el usuario. La base de datos combina la información genómica disponible para cada organismo junto con información extraída automática o manualmente (mediante curación) de la literatura y otras bases de datos relevantes para cada organismo. La base de datos también cuenta con información estructural, genética y química derivada de organismos modelo eucariotas y procariotas. Para aprovechar esta información todos los genes presentes en los organismos de interés han sido mapeados contra sus respectivos ortólogos en organismos modelo. Una aplicación de esta ´inferencia a través de ortología´ es el análisis de viabilidad/potencial de intervención química sobre blancos (druggability). Esta información, disponible en bancos de datos comerciales para blancos en organismos modelo, fue utilizada para derivar un índice numérico similar para los respectivos ortólogos en los genomas de patógenos. A las búsquedas sobre la base de datos pueden asignárseles puntajes numéricos, para crear listas de genes priorizadas de acuerdo a las preferencias de cada usuario. Además de proveer facilidad para la realización de búsquedas, hemos puesto un esfuerzo considerable en la anotación de blancos validados, para permitir la identificación rápida de blancos de alto valor. La base de datos se encuentra accesible en la web en http://tdrtargets.org. Este proyecto fue iniciado por y es financiado por el Programa Especial para Investigación y Entrenamiento en Enfermedades Tropicales (WHO).