Selección genómica en Eucalyptus dunnii: comparación de predicciones obtenidas empleando una estrategia de Genotipado por secuenciación y el sistema comercial de SNP EuChip60K

AGUIRRE, NC; VILLALBA, PV; FILIPPI, CV; RIVAS, JG; GARCIA, MN; ACUÑA, CV; MARTINEZ, MC; LÓPEZ, J.A.; LÓPEZ, A.J.; PATHAUER, PS; PALAZZINI, DA; HARRAND, L.; OBERSCHELP, J; MARCÓ, M; CISNEROS, EF; CARRERAS R.; RODRIGUEZ, JC; CAPPA, EP; PANIEGO, N.; HOPP, HE; GRATTAPAGLIA, D; MARCUCCI POLTRI, SN

Simposio; XIII SIMPOSIO REDBIO ARGENTINA 2021 VIRTUAL; 2021

Eucalyptus dunnii Maiden ha cobrado mayor relevancia a nivel mundial en los últimos años por combinar crecimiento, rectitud de fuste y buenas cualidades para pulpa para papel con potencial para otros usos; siendo una alternativa en áreas templadas y con mayor frecuencia de heladas. En Argentina, el INTA desde 1991 cuenta con un Programa de Mejoramiento Genético para la especie de amplia base genética y actualmente ofrece al sector productivo semilla mejorada localmente para crecimiento y rectitud de fuste. La estrategia de Selección Genómica (SG) permite predecir fenotipos a partir de modelos que emplean datos genómicos y fenotípicos (GBLUP) e incluyendo el pedigrí (ssGBLUP). En este trabajo se genotiparon 280 árboles de una población de E. dunnii de 1520 árboles, aplicando un sistema comercial de 60.000 SNPs (EuChip60K) y una estrategia de Double digest Restriction-site associated DNA sequencing (ddRADseq) puesta a punto para esta especie en particular; obteniendo 8.170 (ddRADSeq) y 19.045 (EUChip60K) SNPs (datos perdidos por SNP 0,01, LD: r2>0,2). Se compararon los desempeños de ambas metodologías de genotipificación para GBLUP y ssGBLUP sobre 14 caracteres relacionados con crecimiento y propiedades químicas de la madera. Para cada modelo se aplicaron 10 validaciones cruzadas (90:10) y se compararon (pruebas t pareadas, p