Análisis de asociación de todo el genoma en Eucalyptus grandis para la identificación de loci de caracteres complejos: crecimiento, calidad y composición química de la madera

GARCIA, MN; AGUIRRE, NC; VILLALBA, PV; RIVAS, JG; ACUÑA, CV; MARTINEZ, MC; CARRERAS R.; MORÁN, M.; ARÉVALOS, C.; ELIZAUL, J.; HOPP, HE; RODRIGUEZ, JC; GRATTAPAGLIA, D; CISNEROS, EF; MARCUCCI POLTRI, SN

Simposio; XIII SIMPOSIO REDBIO ARGENTINA 2021 VIRTUAL; 2021

Eucalyptus grandis es una de las especies más importantes en todo el mundo en las plantaciones forestales para la producción de madera dura, gracias a su rápido crecimiento, buena adaptabilidad y múltiples usos de su madera (papel, celulosa, madera sólida). Es originaria de Australia y tiene una amplia distribución en zonas tropicales y subtropicales del mundo. Los estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) aportan valiosa información decodificando las relaciones entre la variación de la secuencia y los fenotipos complejos, superando al mapeo clásico de locus de rasgos cuantitativos (QTL) mediante cruzamientos biparentales. El mapeo por GWAS permite mapear variaciones genotípicas responsables de los rasgos importantes gracias a las recombinaciones históricas de la población. En particular para especies forestales, posibilita identificar regiones genómicas implicadas en rasgos costosos o difíciles de medir y que tienen relevancia comercial para continuar con los programas de mejora que requieren más tiempo que las especies vegetales de interés agronómico. En este estudio, se realizó un análisis de GWAS para cuatro rasgos de crecimiento (DAP: diámetro a la altura de pecho, corteza, forma y rajado) y seis caracteres de composición química de la madera (extractivos totales, extractivos etanólicos, relación siringilo/guayacilo de lignina, lignina total, celulosa, hemicelulosa) evaluados mediante espectroscopia NIR (Near Infrared) en una población clonal de E. grandis perteneciente a la empresa Desarrollos Madereros S.A. (Paraguay). Se analizaron 689 árboles plantados en seis sitios, con 23400 árboles, con un diseño de fila por columna y cinco réplicas (diseño en quíntuple tree plot con 6 réplicas). La misma fue genotipada con el sistema de alta densidad de marcadores EuChip60K de 60.000 SNPs, resultando en 20634 SNP luego de filtrar por MAF>0,05 y datos perdidos