Validación de nuevos marcadores SSR desarrollados por GBS ddRADseq para la identificación de variedades locales de Prunus salicina Lindl. (ciruelo japonés)

ACUÑA, CINTIA VANESA; LUNA, FLORENCIA; AGUIRRE, NATALIA CRISTINA; FILIPPI, CARLA VALERIA; CERRILLO, TERESA; VALENTINI, GABRIEL; SÁNCHEZ, GERARDO; RIVAS, JUAN GABRIEL; VILLALBA, PAMELA VICTORIA; GARCÍA, MARTÍN NAHUEL; MARTÍNEZ, MARÍA CAROLINA; HOPP, HORACIO ESTEBAN; MARCUCCI POLTRI SUSANA N.

Mendoza

Congreso; XVII Congreso Latinoamericano de Genética, XLVII Congreso Argentino de Genética, LII Reunión Anual de la Sociedad de Genética de Chile, VI Congreso de la Sociedad Uruguaya de Genética, V Congreso Latinoamericano de Genética Humana y V Simposio Latinoameri; 2019

Asociación Latinoamericana de Genética International Genetics Federation

La fruticultura en el delta del Río Paraná tuvo su auge durante la primera mitad del siglo XX, sin embargo, en la actualidad sólo unos pocos productores isleños se dedican a esta actividad.Como parte del rescate de recursos fitogenéticos, el INTA tiene como misión la caracterización del único germoplasma de variedades locales de ciruelo japonés desarrolladas por los productores de la región. En este estudio se evalúo la diversidad genética en una colección de 26 variedades locales, utilizando marcadores microsatélites (SSR) desarrollados a partir de secuencias obtenidas por GBS ddRADseq. Se seleccionaron 20 SSR que fueron validados en 6 individuos para la detección de polimorfismos. Con siete de estos SSR se realizó el estudio de diversidad genética, detectándose 42 alelos totales, con un rango de 3-10 y un promedio de seis alelos por locus. La heterocigocidad observada (Ho) y esperada (He) varió entre 0,31 y 0,96, y entre 0,61 y 0,82, con promedios de 0,75 y 0,74, respectivamente. El Índice de Contenido Polimórfico (PIC) varió entre 0,54 y 0,80, con un promedio de 0,69. El 72% de los valores de distancias genéticas DAS entre individuos fueron mayores a 0,5 con un promedio de 0,61, distinguiéndose todas las variedades inequívocamente. Estos resultados indican que las 26 razas locales fueron genéticamente únicas, descartándose así posibles casos de sinonimia. Estos marcadores se sumarán a los ya evaluados, para desarrollar un sistema de genotipado para la identificación de cultivares, que será utilizado como complemento en futuras inscripciones en el RNC e INASE.