Selección de un set de marcadores EST-SSRs en Eucalyptus globulus y su transferibilidad a otras especies del género.

ACUÑA, CINTIA; FERNANDEZ, PAULA; VILLALBA, PAMELA VICTORIA; GARCÍA, MARTÍN; HOPP, ESTEBAN; MARCUCCI POLTRI, SUSANA

Guadalajara, Jalisco. Mexico

Congreso; REDBIO 2010; 2010

REDBIO

El objetivo de este trabajo fue desarrollar y caracterizar marcadores moleculares funcionales, valorando su utilidad en una muestra de material selecto de distintas especies de Eucalyptus. Se analizaron secuencias no redundantes de ESTs de Eucalyptus globulus publicados en GenBank, para la identificación de regiones microsatélites que fueron validados en esta especie y en otras seis del mismo género (E. grandis, E. saligna, E. dunnii, E.viminalis, E. camaldulensis y E. tereticornis). A partir de 12.690 ESTs públicos explorados, se identificaron 4.924 secuencias no redundantes abarcando 952 de ellas 1.140 regiones SSR. Para validar el potencial de estos marcadores moleculares se evaluaron 57 loci al azar en ocho genotipos de E. globulus. Treinta y siete loci amplificaron y se analizó su transferilibidad a las otras especies. De éstos, 26 amplificaron al menos en cinco especies, mientras que 22 lo hicieron en las seis especies elegidas. Los17 EST-SSRs polimórficos detectados fueron utilizados para el cálculo de parámetros genéticos en una población de 60 individuos no relacionados de E. globulus, representantes de la distribución natural de esta especie. Éstos revelaron un total de 102 alelos (entre 2 y 16 por locus), con un PIC de 0.479 ± 0.068. Este estudio permitió la selección de seis marcadores, con baja frecuencia de alelos nulos estimados, altos número de alelos y PIC y su transferibilidad a las otras seis especies. Estos nuevos marcadores funcionales altamente informativos, proveen una herramienta útil para diversos estudios genéticos como: caracterización, diversidad genética y estudios taxonómicos.