Identificación de genes asociados a la resistencia a la fusariosis de espiga en trigo candeal mediante análisis del transcriptoma

SORESI, D.; DIAZ M; ZAPPACOSTA D; BASUALDO J; REVALE S; CARRERA A

Mar del Plata

Congreso; XLIV Congreso Argentino de Genética; 2015

Sociedad Argentina de Genética

La fusariosis de la espiga de trigo (FET), causada por Fusarium graminearum genera pérdidas en el rendimiento y contaminación con micotoxinas. La resistencia de las variedades cultivadas de candeal es limitada. LDN(Dic-3A)10 es una línea resistente derivada de la var. Langdon (LDN) de T. turgidum spp. durum por introgresión con T. dicoccoides (Qfhs.ndsu-3AS). Nuestro objetivo es identificar genes asociados a la resistencia a FET mediante secuenciado del transcriptoma. Se inocularon espigas de LDN y LDN(Dic-3A)10, se extrajo ARN 72 hs post-inoculación y se secuenció mediante Illumina (tres replicas por genotipo). Se obtuvieron un total de 120.320.001 lecturas de calidad, ensambladas de novo mediante Trinity en 240.741 transcriptos (long. promedio 695pb). Para la anotación funcional de los transcriptos se usaron las bases: SwissProt, TrEMBL, Pfam y GeneOnthology. Se identificaron 1.364 transcriptos diferenciales de los cuales 678 fueron inducidos en LDN(Dic-3A)10. De ellos, los de expresión nula en LDN se mapearon sobre la base URGI de T. aestivum por brazo cromosómico. En el cromosoma 3AS (donde se encuentra la región introgresada de T. dicoccoides) se localizaron 41 transcriptos: 15 mostraron homología con proteínas (FAR1, Cytochrome P450, receptor kinase, NRT1/PTR Family, Cytokinin dehydrogenase, GPI mannosyltransferase, Sphingosine-1-phosphate lyase, Serine/threonine-protein phosphatase), 14 con proteínas de función desconocida y los restantes no mostraron identidad. Los genes que colocalizan con el Qfhs.ndsu-3AS son investigados en genotipos con diferentes niveles de resistencia a FET y en relación a su rol en vías específicas de respuesta.