Inducción diferencial de HSPs evaluada por ARN-seq en dos especies de tomate (Solanum spp.) durante la madurez del fruto

ARCE, DEBORA PAMELA; CACCHIARELLI, PAOLO; GIMENEZ, MAGALI DIANA; RODRÍGUEZ, GUSTAVO RUBÉN; PRATTA, GUILLERMO RAUL

Mendoza

Congreso; XVII Congreso Latinoamericano de Genética; 2019

La expresión de los 33 miembros de la sub-familia génica delas smallheat shock proteins (sHSPs) durante la madurez de tomate está biencaracterizada en el cultivar Heinz 1706 (H). Los genotipos Caimanta (C, S.lycopersicum) y LA0722 (P, S. pimpinellifolium) discrepan para caracteres delfruto tales como peso, vida pos-cosecha, acidez y dureza. El objetivo fueanalizar la expresión a nivel de ARNm de sHSPs en C y P. Se secuenciaron lostranscriptomas de C y P (NovaSeq, Illumina) en los estados verde maduro (V),pintón (Pi) y rojo (R). Los reads obtenidos se alinearon contra la regióncodificante de las 33 sHSPs de H utilizando el programa bowtie v.1.2.0. Para elanálisis de expresión diferencial se utilizó edgeR. Se consideraron inducidos aquellos genes con un logFC>1,5 (p<0,05). Para C, se observaron4 (Solyc03g082420, Solyc05g014280, Solyc06g076540 y Solyc03g113930) y 5 (lasanteriores más Solyc11g020330) sHSPs inducidas durante el estado P y Rcomparado con V, respectivamente. En el estado Pi de P, se observaron 5 sHSPsinducidas (Solyc05g014280, Solyc11g020330, Solyc08g078700, Solyc03g012340 ySolyc09g015020), mientras que sólo una sHSP inducida (Solyc05g014280) en estadoR. Si bien el número de sHSPs inducidas es similar y son mayormentecitosólicas, en P se observó la presencia de una sHSP mitocondrial(Solyc08g078700) en estado Pi, mientras que en C aparece inducida sólo una sHSPcloroplástica (Solyc03g082420) en Pi y R. Finalmente, Solyc05g014280 siempreaparece inducida en ambos genotipos para ambos estados de madurez.