Identificación de regiones genómicas asociadas a morfología de fruto por análisis de grupos segregantes en un cruzamiento intraespecífico de tomate

GODOY, FEDERICO N. I.; VAZQUEZ, DANA V.; CAMBIASO, VLADIMIR; PEREIRA DA COSTA, JAVIER H; RODRÍGUEZ, GUSTAVO RUBÉN

Rio Cuarto

Congreso; LI Congreso Argentino de Genética; 2023

Sociedad Argentina de Genética

En tomate (Solanum lycopersicum L.) los genes SUN, OVATE, SOV1 y FS8.1 controlan la forma del fruto en el plano próximo-distal. En un cruzamiento interespecífico entre el cultivar Rio Grande y una accesión silvestre se comprobó que el carácter índice de forma de fruto (IF= altura/diámetro) es mayormente controlado por FS8.1 y una región ubicada en la base del cromosoma (cr) 2. En este trabajo se buscó validar estos QTLs determinantes de IF e identificar nuevas regiones asociadas al carácter mediante la metodología de QTL-seq. Se evaluaron 200 plantas F2 derivadas del cruzamiento entre dos cultivares que portan alelos iguales en los genes de forma conocidos, excepto en FS8.1: Rio Grande (fs8.1-/-) y LYC1907 (fs8.1+/+). Se analizó molecularmente FS8.1 en la población. Se crearon tres grupos de 15 plantas homocigotas para FS8.1: dos grupos fs8.1+/+, con IF bajo y alto respectivamente, y un grupo fs8.1-/- con IF alto. Se comparó por prueba de t el IF medio entre grupos. Se secuenciaron sus genomas completos y se alinearon al genoma de referencia (SL4.0). Se detectaron polimorfismos y por QTL-seq se buscaron regiones genómicas asociadas a IF. La población F2 presentó segregación molecular para FS8.1. Los grupos se diferenciaron significativamente por su IF. Entre los 801363 SNPs detectados, se encontraron asociaciones a IF en el cr 8 (en una región cerca de FS8.1), en el cr 2 (en regiones distales a la esperada) y también en los cr 3, 7 y 9. Se pudo validar el gen FS8.1 pero no la región del cr 2. Además, se encontraron nuevas regiones en otros cromosomas que se asociaron a IF.