DISECCIÓN DE UNA PROTEÍNA MODELO B (IFABP): DIFERENCIAS Y SEMEJANZAS ESTRUCTURALES DE LAS VARIANTES ABREVIADAS

CURTO L.M.; FRANCHINI, G.R.; CARAMELO JJ; DELFINO J.M.

C. A. de Buenos Aires

Jornada; 153° Jornada Científica Academia Nacional de Farmacia y Bioquímica.; 2009

Academia Nacional de Farmacia y Bioquímica.

La IFABP (proteína que une ácidos grasos de intestino de rata, 15kDa) es un barril- constituido por 2 hojas ortogonales de 5 hebras cada una, que delimitan el bolsillo de unión del ligando ácido graso y un subdominio -helicoidal interpuesto entre las 2 primeras hebras. De la proteólisis con Arg-C de holo-IFABP (en presencia de ácido oleico) se obtuvo una variante abreviada y funcional: 98 (11kDa). Esta carece de la primera hebra-, la mayor parte del subdominio -helicoidal, y del pentapéptido C-terminal. A pesar de carecer del cierre del barril, 98 es monomérica, con un ?core? hidrofóbico compacto y una periferia laxa. Del mismo modo, holo-98 fue sometida a proteólisis generando así una segunda variante funcional y abreviada en 20 aminoácidos del extremo C-terminal: 78. Notablemente, 78 experimenta un rearreglo conformacional que la transforma en un dímero estable (19kDa). Resultados preliminares indicarían que la digestión de holo-78 permitiría obtener una tercera variante abreviada (58). Así, la disección progresiva de IFABP genera variantes funcionales que han sido clonadas y expresadas y cuya caracterización biofísica apoya la noción anti intuitiva de que la integridad del barril- puede comprometerse sin perjuicio para la habilidad de adoptar un plegamiento semejante al nativo o la función.