Predicción y selección de candidatos vacunales contra la coccidiosis aviar mediante herramientas bioinformáticas

BRITEZ, JESICA DAIANA; RODRIGUEZ, ANABEL E; TOMAZIC, MARIELA L

Simposio; Simposio de Estudiantes Hispanohablantes de Bioinformática y Biología Computacional - SEH2Bioinfo; 2022

SEH2 bioinfo

La coccidiosis es una parasitosis de alto impacto económico en la producción avícola. Es causada por parásitos del género Eimeria. Existen siete especies aviares y generan inmunidad especie-específica. Actualmente, se emplean vacunas vivas que poseen ciertas desventajas. Las vacunas recombinantes están en desarrollo y aún no están comercialmente disponibles. Para ello, la búsqueda de nuevos antígenos es fundamental. Se demostró experimentalmente que las proteínas con anclaje a glicosilfosfatidilinositol (GPI) son buenas candidatas vacunales ya que generan respuesta inmunogénica. El objetivo de este trabajo fue predecir y seleccionar potenciales candidatos vacunales de dos de las especies más frecuentes E. tenella y E. acervulina a través de una estrategia secuencial bioinformática para el futuro desarrollo de una vacuna recombinante. Se comenzó con la predicción del secretoma, mediante Signal-P. Se usaron 4 programas de predicción de la señal de anclaje a GPI. Se descartaron proteínas con más de un dominio transmembrana o con localización subcelular. Además, se usó UniProt, ToxoDB, BLAST y NetMHCpan para ampliar el análisis. Para el estudio de conservancia se comenzó con 2 genes de E. tenella, Etsag1 y Etsagta4. Se diseñaron oligonucleótidos específicos, se amplificaron los genes de 2 aislamientos locales y una cepa de referencia propagada experimentalmente, y se secuenciaron. Las secuencias se editaron con el programa BioEdit y se alinearon mediante Clustal Omega regiones conservadas. De 6864 proteínas de E. acervulina y 8627 de E. tenella se preseleccionaron 11 y 23 respectivamente, con anclaje a GPI, localización superficial, transcripción en el primer estadio infectivo asexual, rol en la invasión y sitios de unión a MHC I. Etsag1 y Etsagta4 demostraron 100 % y 99. 8 % de conservación respectivamente, hallando una mutación con cambio de sentido en Etsagta4. Concluyendo, se logró predecir y seleccionar proteínas con características relevantes para considerarse como candidatos vacunales.