DISPERSIÓN INICIAL DEL VIRUS SARS-COV-2 EN EL ÁREA MÉTROPOLITANA DE BUENOS AIRES

KÖNIG GA; TORRES C; AULICINO P; VALINOTTO L; PUEBLA A; ZUBRZYCKI J; BLANCO FERNANDEZ MD; MOJSIEJCZUK L; CULASSO A; NABAES JODAR M; VIEGAS M

Congreso; XIII Congreso Argentino de Virología; 2021

El virus SARS-CoV-2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) descubierto en la ciudad de Wuhan, China, a fines del 2019, se expandió rápidamente a un nivel global provocando la pandemia de COVID-19.El objetivo del Proyecto PAIS en este trabajo fue identificar el establecimiento inicial de clusters de transmisión locales y su distribución en las distintas regiones de CABA y la Provincia de Buenos Aires (PBA), así como la relación entre ambos distritos. Este trabajo fue llevado a cabo de marzo a julio de 2020.Para CABA, el periodo en estudio comprende desde la semana epidemiológica 17 (SE17) hasta la 27 y para la PBA de la SE 13 a la 24. Se obtuvieron, respectivamente, 183 y 122 secuencias de genoma completo de SARS-CoV-2 provenientes de muestras clínicas de pacientes con la COVID-19. Se utilizó el método de amplificación de ARTIC y secuenciación de nueva generación por ILLUMINA.En la CABA se observó presencia de al menos 6 linajes distintos de SARS-CoV-2, con predominancia del linaje B.1.499. En la PBA el análisis mostró una marcada regionalización de los cluster genéticos, compatible con circulación viral comunitaria sostenida restringida a zonas geográficas específicas (GBA-Norte, GBA-Oeste, GBA-Sur y Gran La Plata).Si bien en algunos casos se observó relación cercana entre secuencias de la PBA y de la CABA, este patrón no fue el predominante. Los análisis de estructuración geográfica indicaron que, aunque un mismo linaje viral puede encontrarse simultáneamente en distintas regiones geográficas, el patrón general observado es la introducción viral y diversificación zonal restringida, más que la circulación irrestricta de los linajes entre las distintas zonas. Este proceso de diversificación viral es compatible con las restricciones de circulación poblacional debido a las medidas adoptadas en el comienzo de la pandemia, cuando el movimiento de personas mayormente estaba restringido a sus zonas de pertenencia.