DINÁMICA DE LA VARIANTE LAMBDA SARS-COV-2 (LINAJE C.37) EN ARGENTINA

NABAES JODAR MS; MOJSIEJCZUK LN; TORRES C; ACUÑA D; ALEXAY S; AULICINO P; GOYA S; KÖNIG G; LUSSO S; NATALE M; VALINOTTO L; PROYECTO PAIS; VIEGAS M

Congreso; XIII Congreso Argentino de Virología; 2021

A fines de 2020, el Consorcio PAIS implementó la vigilancia molecular del SARS-CoV-2 centrada en el monitoreo de variantes de preocupación y de interés (VOC/VOI). La estrategia se basó en la detección de mutaciones distintivas en la proteína Spike mediante secuenciación de Sanger de muestras recolectadas semanalmenteEn este trabajo, describimos la emergencia y dispersión de la VOI Lambda en el AMBA, epicentro de la epidemia de COVID-19 en Argentina. Además, se realizó un análisis filodinámico para identificar las relaciones genéticas, la dispersión temporal y geográfica de los aislamientos locales y globales.La variante Lambda se detectó en 604 de 2287 secuencias recolectadas entre las SE-44/2020 y SE-36/2021 en el AMBA. La primera detección fue el 20/01/20, su frecuencia aumento marcadamente desde febrero hasta alcanzar el 32,5% en la SE-36/2021, convirtiéndose con Gamma en las variantes dominantes.Se obtuvieron 133 genomas completos y se realizaron análisis filogenéticos y filodinámicos junto con secuencias de bases de datos. En general, la filogenia mostró una marcada estructura geográfica, con secuencias del mismo país agrupadas en clados con alto soporte estadístico.El análisis filodinámico ubicó al ancestro común de Lambda en Perú en noviembre de 2020. Las secuencias argentinas se ubicaron en seis clados, evidenciando múltiples introducciones al país: cuatro desde Perú y dos desde Chile. Cuatro de estos seis clados mostraron ancestros en el AMBA, y desde allí se dispersaron a otras regiones del país. Los ancestros comunes de los dos grupos argentinos mayoritarios fueron datados entre fines de diciembre 2020 y principios de enero de 2021.La vigilancia molecular y la reconstrucción filodinámica indicaron que la introducción y dispersión de Lambda coincidió con el pico de casos de COVID-19 que ocurrió después de las celebraciones de fin de año. Una vez establecido en el AMBA, el linaje se dispersó a otras regiones, contribuyendo a la segunda ola en Sudamérica.