IDENTIFICACIÓN DE UN NUEVO SUBGENOTIPO DEL VIRUS DE HEPATITIS B GENOTIPO F A PARTIR DE MUESTRAS DE PACIENTES CON INFECCIÓN CRÓNICA DE ARGENTINA

MOJSIEJCZUK, L.N.; TORRES, C.; RÉ, V.; PISANO, M.B.; FAINBOIM, H.A.; GALDAME, O.A.; CAMPOS, R.H.; FLICHMAN, D.M.

Congreso; XI Congreso Argentino de Virología, II Congreso Latinoamericano de Virología; 2015

El virus de la hepatitis B (HBV) se clasifica en ocho genotipos (A-H) en base al análisis de distancias genéticas entre secuencias de genoma viral completo. El genotipo F, considerado originario de los pueblos nativos americanos, es uno de los más prevalente de Argentina y hasta la actualidad se ha clasificado en cinco subgenotipos (sgt) denominados F1 a F5. El objetivo de este trabajo fue realizar una caracterización y análisis evolutivo de seis genomas completos del HBV genotipo F. Tres de ellos fueron aislados de pacientes residentes en la Ciudad de Buenos Aires y, los restantes, en la Provincia de Córdoba. Las secuencias, junto a referencias obtenidas de GenBank, fueron alineadas (ClustalX v2.1) y editadas (BioEdit v7.1.3.0). El posible origen recombinante de las secuencias se evaluó con el programa Simplot v3.5.1. Se realizó un análisis filogenético por el método de Máxima Verosimilitud (PhyML v3.0), se calcularon las distancias genéticas entre grupos (MEGA6) y se llevó a cabo un análisis de coalescencia por metodología bayesiana (paquete BEAST v1.7.5). Como resultado del análisis filogenético, se observó que los seis aislamientos formaron un grupo monofilético dentro del genotipo F, con alto soporte estadístico, pero separado de los demás sgt descriptos hasta el momento. Las distancias genéticas calculadas entre el nuevo grupo y secuencias de referencia del genotipo F se encontraron entre el 4,03 %, respecto al sgt más cercano: el F4, y 6,20% en relación al sgt F1. A lo largo del genoma, las seis secuencias presentaron 19 posiciones nucleotídicas únicas y características, no observadas en los demás sgt. En los cuatro marcos abiertos de lectura que presenta el genoma de HBV, dichas sustituciones generan 12 cambios por codones sinónimos y 11 no sinónimos. En base a estos últimos, se puede establecer un patrón de aminoácidos únicos y característicos del nuevo grupo: sp254L, sp271K, sp314P, rt21I, rt132D, rt261E, rt277R, rh743R y rh807L en la polimerasa viral, 91N en PreS1 y 47S en la proteína X. Por otra parte, el análisis de coalescencia situó al ancestro común más reciente (ACMR) del nuevo grupo en el año 1030 d.C. [HPD95%=1386-480 d.C.], con una diversificación entre los años 1100 a 1430, lo que coincide con el período de expansión poblacional de los demás sgt reconocidos del genotipo F. Dadas las actuales recomendaciones para la clasificación del HBV que asigna como nuevo subgenotipo a un grupo monofilético, con soporte estadístico y con distancia genética entre 4.0 y 7.5% con los grupos anteriormente reportados, se propone que los seis genomas descriptos en este trabajo componen un nuevo sgt del HBV: el sgt F6. La identificación de nuevos subgenotipos permite profundizar los conocimientos sobre la historia evolutiva del HBV, así como clarificar la relación entre los (sub)genotipos virales y la historia natural de la infección.