CIRCULACIÓN DE VARIANTES DEL GENOTIPO GII.4 DE NOROVIRUS EN ARGENTINA

BLANCO FERNÁNDEZ, M.D.; TORRES, C.; CAMMARATTA, R.; MBAYED, V.A.

Otro; XXXII REUNION CIENTIFICA ANUAL DE LA SOCIEDAD ARGENTINA DE VIROLOGIA; 2012

Norovirus (NoV) es el principal agente causal de gastroenteritis viral aguda en todo el mundo, afectando personas de todos los rangos etarios. El genotipo GII.4, entre 19 genotipos del genogrupo II, ha causado más del 85% de los brotes de gastroenteritis por NoV. Se ha observado la emergencia de nuevas variantes cada 2 o 3 años que reemplazan a la variante anterior. El objetivo del presente trabajo fue caracterizar en tres regiones genómicas las secuencias obtenidas de NoV GII.4 en muestras ambientales de Argentina entre el 2005 y el 2012. Se detectó la presencia de NoV en 53 de 209 (25.4%) muestras ambientales de ríos de la provincia y ciudad de Buenos Aires, ciudad de Salta y ciudad de Córdoba utilizando la región A de la polimerasa ARN dependiente de ARN de NoV. De las 53 muestras positivas, 33 pudieron ser secuenciadas y 27 pertenecieron al GII.4. Se amplificó entonces la región C y D de la proteína de cápside VP1. Se construyeron arboles filogenéticos con las 3 regiones para identificar las variantes presentes en las muestras. Solo 21 de las 27 muestras secuenciadas en la región A pudieron ser amplificadas en la región C. Doce de las 27 muestras de GII.4 secuenciadas (52.2%) pertenecieron a la variante epidémica 2006b de acuerdo con las tres regiones secuenciadas. Se observó la presencia también de las variantes Hunter (2004) en una secuencia obtenida en el 2005 y posteriormente también la variante 2010 en 2 secuencias de Buenos Aires obtenidas en el 2010. Otras 2 secuencias no pudieron ser clasificadas en una variante determinada, ya que en la región A agrupaban con la variante 2006b, mientras que en la región C estaban relacionadas con la variante 2008. La discrepancia en los resultados de la secuenciación puede deberse a la naturaleza de las muestras ambientales (mezclas complejas de distintos virus provenientes de la excreción desde diferentes individuos infectados) o al origen recombinante de la variante que surgió en el 2008. En contraste con la región C y A, la región D pudo ser amplificada y secuenciada solo cuando se diseñaron primers específicos para la variante 2006b. Los análisis realizados en esta región permitieron observar que las secuencias de Buenos Aires, Córdoba y Salta obtenidas entre el 2009 y el 2010 formaron un cluster con secuencias de Francia, Japón y Taiwán reportadas en 2008 y 2009. Mientras que otra secuencia del 2006 agrupaba con secuencias aisladas en Brasil en el mismo año y con secuencias de Rusia de muestras obtenidas entre el 2006 y 2010. En conclusión, el genotipo GII.4 responsable de los brotes pandémicos de NoV se encuentra circulando en nuestro país y exhibe el recambio de variantes que ha sido descripto para este genotipo en el resto del mundo. Aunque la circulación de nuevas variantes emergentes del genotipo II.4 como la 2008 o la 2010 han sido reportadas, la variante 2006b es la predominante en Argentina circulando desde al menos el 2006 al 2010.