Análisis de la metilación de ADN en sangre en un modelo murino de prediabetes: identificación de potenciales marcadores para la detección temprana de la diabetes tipo 2

MENCUCCI, MV; LACUNZA, E; ABBA, M; AHRTZ, L; DUMRAUF, B; VILLAGARCÍA, HG; CASTRO MC; ROMÁN, CL; FLORES, LE; GAGLIARDINO, JJ; FRANCINI F; MAIZTEGUI, B

La Plata

Jornada; Jornada de Investigación FCM*UNLP 2023; 2023

Facultad de Cs. Médicas-UNLP

Introducción: El diagnóstico tardío de la diabetes tipo 2 (DT2) representa una de las principales dificultades clínicas de esta enfermedad. La prediabetes (PD) precede a las manifestaciones clínicas de la DT2, y su detección es crucial ya que adoptar estilos de vida saludables a tiempo puede prevenir su progresión a DT2. Las alteraciones en la metilación del ADN se han asociado al desarrollo y progresión de la DT2, sin embargo, las alteraciones asociadas a la PD fueron poco exploradas. Su estudio permitirá la posible identificación de biomarcadores que faciliten su detección temprana para diseñar estrategias de prevención de la DT2.Objetivo: Caracterizar los perfiles de metilación del ADN en muestras de sangre de un modelo murino de PD, siguiendo su evolución durante la reversión de la PD.Materiales y Métodos: Ratas macho Sprague Dawley se dividieron en 3 grupos: control (C), prediabetes (PD) y reversión (R). El grupo C consumió agua y el grupo PD una solución de fructosa al 10% p/v durante 70 días. El grupo R consumió la solución de fructosa durante 21 días para establecer la PD, y luego dicha solución se reemplazó por agua durante 49 días para revertir el estado de PD. Se recogieron muestras de sangre para medir parámetros séricos y aislar el ADN. Se utilizó el secuenciamiento del genoma completo con bisulfito para analizar la metilación del ADN. El análisis de datos incluyó: 1) el control de calidad y el preprocesamiento de las lecturas utilizando el paquete de R/Bioconductor Rfastp; 2) la alineación de las lecturas con el genoma de referencia de rata (versión rn6) y la determinación de los niveles de metilación de los sitios de dinucleótidos de citosina-guanina (CpG) utilizando el programa Bismark; 3) el análisis de metilación diferencial y la anotación de los sitios CpGs con el paquete de R/Bioconductor Methylkit; 4) y el análisis de enriquecimiento funcional utilizando el paquete de R/Bioconductor Clusterprofiler.Resultados: Los animales del grupo PD mostraron un aumento significativo de los niveles de triglicéridos plasmáticos y del indicé de resistencia a la insulina (TG/col-HDL) respecto al grupo C (p