Modificaciones transcripcionales producidas por INGAP-PP en islotes del páncreas en rata

HEIDENREICH, AC; ROMERO AGUSTÍN; ALGAÑARÁS, M; ROMÁN, CL; GAGLIARDINO, JJ; MAIZTEGUI, B; FLORES, LE; RODRÍGUEZ SEGUÍ, SA

Buenos Aires

Jornada; 1era Jornada Itinerante de Epigenética; 2022

USAM

La diabetes tipo 2 (T2D) se caracteriza por un deterioro de la masa/función de las células β pancreáticas junto con un estado de resistencia a la insulina. INGAP es una proteína pancreática que modula la masa de células β y la secreción de insulina en presencia de secretagogos, y sus efectos también los logra su derivado pentadecapéptido (INGAP-PP). INGAP-PP modula la expresión génica de algunos mediadores de vías de señalización relacionadas con la neogénesis, activación de células β, apoptosis, secreción de insulina, entre otras que podrían modular la función/masa de las células β. La anotación de novo de genes a partir de datos RNA-seq obtenidos para islotes pancreáticos de rata tratados o no con INGAP-PP nos permitió identificar transcriptos no anotados previamente en el genoma de rata que son modulados por el tratamiento. Para caracterizar estos nuevos potenciales genes, combinamos el análisis de modificaciones postraduccionales de histonas (H3K4me1, H3K4me3, H3K27ac, H3K36me3, H3K79me2) obtenidas por ChIP-seq en células INS1 (derivadas de células β), disponibles a partir de bases de datospúblicas. Empleando las herramientas disponibles en el paquete Bedtools, identificamos regiones Promotoras y Enhancer activas y latentes en células INS1. El solapamiento de estas regiones con las anotaciones de novo de los genes regulados por INGAP-PP nos permitió priorizar candidatos que tengan especial relevancia en la función de las células β pancreáticas. Nuestro trabajo en curso apunta a estudiar los mecanismos epigenéticos que podrían estar siendo regulados frente al tratamiento con INGAP-PP en los islotes de rata.