Caracterización molecular de aislamientos de Macrophomina phaseolina empleando marcadores ITS-rDNA

SPEDALETTI Y; PEREZ BRANDAN C; FIRME F; APARICIO M; GALVÁN M

San Luis

Jornada; XIV Jornadas Fitosanitarias Argentinas; 2012

UNLS

La podredumbre carbonosa de la soja (Glycine max L.) causada por el hongo Macrophomina phaseolina Tassi (Goid.) es una de las enfermedades que causa mayores pérdidas en la producción de Salta. Conocer la biología del patógeno e identificar posibles estrategias de manejo es fundamental para desarrollar estrategias efectivas. Por ello el objetivo del presente trabajo fue realizar la caracterización molecular de 20 aislamientos de M. phaseolina de soja recolectados en la provincia de Salta. La extracción de ADN se realizó a partir de aislamientos obtenidos de raíz y mantenidos en medio APG durante 15 días a 25 ±2°C. A partir del ADN extraído se amplificaron las regiones ITS-rDNA (inter transcribed spacers) mediante PCR utilizando los primers ITS1 e ITS4. Los fragmentos amplificados se separaron por electroforesis en geles de agarosa 1,5% teñidos con GelRedTM y se secuenciaron. La identificación de las secuencias se obtuvo realizando una comparación con secuencias de la base de datos del NCBI (Centro Nacional de Información Biotecnológica, www.ncbi.nlm.nih.gov) utilizando el algoritmo Blastn. El alineamiento de las secuencias y su comparación se realizó con ClustalW2. A partir del análisis de las secuencias se pudo identificar las variaciones presentes en las mismas y se generó un árbol de Neighbor-joining que agrupó a la mayoría de los aislamientos en un mismo cluster mostrando gran similitud con secuencias de aislamientos del patógeno obtenidos a partir de soja empleadas como control. Las secuencias ITS demostraron ser una herramienta de utilidad para la identificación de los aislamientos estudiados.