Vigilancia de SARS-CoV 2 en aguas superficiales y residuales durante la pandemia de COVID-19

DIEGO GASTÓN SANGUINO JORQUERA; MARÍA NOEL MAIDANA KULEZSA; HUGO RAMIRO POMA; MERCEDES CECILIA CRUZ; MÓNICA APARICIO GONZÁLEZ; MARÍA DEL MILAGRO SAID-ADAMO; HÉCTOR ANTONIO CRISTÓBAL; VERÓNICA PATRICIA IRAZUSTA; VERÓNICA BEATRIZ RAJAL

Jornada; II Jorrnadas provinciales de Investgación en Salud Humana; 2023

Durante la pandemia de COVID-19 se desconocía si la ruta oral-fecal podía ser una vía de transmisión y los ríos una fuente de contagio. Además, debido a la escasez de reactivos para testear no se conocía la extensión de la circulación viral en la ciudad de Salta. Los objetivos de este trabajo fueron: 1) Detectar el SAR-CoV-2 en aguas superficiales, 2) Determinar la concentración viral en aguas residuales de la ciudad de Salta, y 3) Evaluar si las aguas superficiales y residuales pueden aportar información para la vigilancia epidemiológica. Se monitorearon periódicamente los ríos La Caldera, Mojotoro y Arenales entre julio y diciembre de 2020 y se continuó el último hasta setiembre de 2021. Se midieron in situ turbidez, conductividad, pH y temperatura, con sonda multiparamétrica. Se colectó 1 L de agua para la determinación, mediante cultivo, de bacterias indicadoras de contaminación fecal: coliformes totales y termotolerantes, Escherichia coli y enterococos. También se colectaron 20 L de agua que se concentraron por ultrafiltración hasta 80 mL.Las aguas residuales se analizaron desde agosto de 2020, inicialmente en 13 colectoras principales y luego en seis, alcanzando una cobertura del 79% de la población servida en la ciudad de Salta. Se colectaron periódicamente muestras puntuales de las bocas de registro, que se desactivaron a 60 °C por 90 minutos. A partir de 50 mL se realizó la concentración viral con polietilenglicol y centrifugación y se resuspendió el pellet obtenido en TRIzol™. Se extrajo el ARN de los concentrados con un kit comercial y se hizo la detección de SARS-CoV-2 mediante RT-qPCR en un paso.Las características fisicoquímicas y bacteriológicas de los ríos evaluados fueron diferentes mostrando el impacto de la actividad humana. El río La Caldera mostró la mejor calidad (apto para uso recreativo), seguido del Mojotoro y del Arenales, con alta contaminación fecal. En los ríos La Caldera y Mojotoro se detectó el SARS-Cov-2 en concentraciones bajas en aproximadamente la mitad de las muestras. En el Arenales se encontró el virus en casi todas las muestras, con concentraciones especialmente altas en uno de los puntos monitoreados, tales que permitió seguir la curva epidemiológica de la población.En las aguas residuales se detectó el virus en casi todas las muestras, con concentraciones variables en el tiempo y las zonas servidas, anticipándose a los picos epidemiológicos. Se asociaron distintos colores a rangos de concentraciones virales, para construir mapas semáforos que representen la circulación viral en cada momento.El análisis de las aguas residuales y de los ríos altamente impactados por ellas, como el Arenales, permite la vigilancia ambiental de los patógenos que circulan en la población haciendo un aporte valioso para la epidemiología.