Evaluación in silico de compuestos polifenólicos como posibles inhibidores de la arginina quinasa de Trypanosoma cruzi

VALERA, EDWARD; MIRANDA, MARIANA; REIGADA, CHANTAL; SAYE, MELISA; PEREIRA, CA

CABA

Simposio; XVII Simposio Internacional Sobre Enfermedades Desatendidas de la Fundación Mundo Sano; 2015

Fundación Mundo Sano

Introducción:La arginina quinasa (AK) es una enzima de gran importancia en el equilibrio energético de Trypanosoma cruzi, así como en la resistencia a distintos tipos de estrés. Por su ausencia en el hospedador mamífero, la AK es un buen blanco quimioterapéutico. Se han reportado pocos inhibidores de esta enzima, todos ellos pertenecientes al grupo de los polifenoles. Por esta razón se decidió probar modelos in silico de la unión de representantes de varios grupos de polifenoles al sitio activo de la AK.Materiales y métodos: De la base de datos de compuestos disponibles comercialmente, ZINC, se obtuvieron las estructuras 3D de los ligandos probados. A estas estructuras se les minimizó la energía en el servidor PRODRD2. La estructura cristalina de la AK de T. cruzi se obtuvo de la base de datos de proteínas de RCSB y se completaron los residuos faltantes con la AK de Limulus poliphemus. Usando el programa AutoDock Tools se ensayaron los diferentes ligandos, fijandose como flexibles los residuos de la AKSer63, Gly64, Ile65, Tyr68, His315, Glu225, Glu314, Cys271, que han sido reportados como importantes en la unión o catálisis de la arginina. Los grupos con menor energía de se tomaron como formas representativas de la unión de los ligandos. Se compararon las energíaslibres de unión (∆G) mínimas de cada complejo enzima-ligando usando como control positivo el modelado del complejo AK-arginina.Resultados y discusión: De los ligandos probados 6 tuvieron un∆G menor a la del control con arginina (-8,11), de los cuales el menor ∆G fue el calculado para el compuesto rutina (-13,89). La parte fenólica de la rutina se localizó en el bolsillo hidrofóbico del sitio activo, mientras que el disacárido estaría interactuando con residuos polares, resultando en una mayor afinidad por la enzima en comparación a los otros polifenoles probados, los cuales no están glicosilados. Mediante esta estrategia se elegirán los compuestos para realizar ensayos in vitro de inhibición de la AK recombinante y nativa, posteriormente evaluando su acción tripanocida en cultivo.