Búsqueda bioinformática de familias génicas y predicción de rutas metabólicas en el genoma no ensamblado de Trypanosoma cruzi.

BOUVIER, LEON; CANEPA, GASPAR; MIRANDA, MARIANA; SILBER, ARIEL; PEREIRA, CA

Rosario

Congreso; XX Reunión de Protozoología y Enfermedades Parasitarias; 2004

Si bien el genoma de Trypanosoma cruzi se encuentra secuenciado de manera redundante, aun no esta disponible una versión ensamblada completa del mismo. Esto nos llevó al desarrollo de rutinas bioinformáticas capaces de buscar y ensamblar secuencias de interés de forma automática. Aplicando estas herramientas estudiamos algunas rutas del metabolismo de los aminoácidos arginina, prolina, aspartato y glutamato, dado que estos no solo son utilizados como fuente de carbono, sino que también estarían involucrados en procesos de diferenciación y como reservorios de energía. Con la predicción bioinformática, se diseñó un esquema de los posibles pasos iniciales de cada  una de las rutas, incluyendo los transportadores de dichos aminoácidos. En dicho esquema se señalan aquellas enzimas posiblemente ausentes en el parásito, como así también enzimas diferenciales con el hospedador vertebrado. En cuanto a los transportadores de aminoácidos se han identificado sesenta miembros de la familia mayoritaria denominada “Permeasas de Amino Acidos/Auxinas (AAAP)”, corroborándose además la expresión de los mismos en el parásito. La construcción de mapas metabólicos bioinformáticos constituye un buen punto de partida para la futura caracterización bioquímica de cada uno sus componentes y para el análisis global del metabolismo de T. cruzi.