Estimación de la interacción genotipo-ambiente en selección genómica

RUEDA CALDERÓN, A.; BRUNO, C.; BALZARINI, M.

Catamarca

Congreso; XLVI Congreso Argentino de Genética; 2017

En los ensayos multiambientales (Multienvironment trials, MET) donde se evalúan genotipos (G) en diferentes ambientes (A) es posible identificar fuentes de variación atribuibles a efectos de la interacción genotipo-ambiente (GxA). La información proveniente de marcadores moleculares ha permitido estudiar la asociación genotipo- fenotipo y avanzar hacia la selección genómica (SG). Sin embargo, aún existen desafios metodológicos para incorporar el efecto de la interacción GxA en los modelos de asociación genómica. En este trabajo se comparan dos estrategias de incorporación de la interacción GxA en el modelo de SG, una trata al fenotipo en cada ambiente como un vector respuesta multivariado para estimar la correlación de los rankings de G entre A, y considera separadamente la correlación genética derivada de la matriz de datos moleculares. La segunda estrategia incorpora la correlación producto (kronecker) de los efectos ambientales y de relaciones genotípicas. Los resultados de ambos modelos fueron comparados con un modelo lineal mixto (MLM) para cada ambiente con efecto aleatorio de genotipo. Se ilustran los procedimientos a partir de una base de datos de trigo pública disponible en el paquete BGLR de R que contiene información molecular de 599 líneas de trigo y cuatro años de rendimiento, considerados como cuatro ambientes diferentes. Ambas estrategias para considerar GxA produjeron resultados similares e identificaron con mayor precisión los marcadores de mayor contribución para la SG que el MLM por ambientes.