Una aplicación geoestadística en genómica

BRUNO, C.; BALZARINI, M.

La Falda, Córdoba.

Congreso; 2º Escuela Argentina de Matemática y Biología; 2007

BIOMAT

Los patrones de dispersión en animales, en especial los producidos en escala microgeográfica, se caracterizan por presentar variabilidad espacial que se manifiesta estadísticamente a través de correlaciones entre observaciones registradas en un área. Las distancias genéticas entre pares de individuos pueden ser usados para inferir las magnitudes de tales correlaciones. Cuando se dispone de muestras genómicas geo-referenciados es posible analizar variaciones de relaciones genéticas en una dimensión espacial mediante modelos geo-estadísticos que estiman correlogramas (correlaciones genéticas en función de distancias geográficas). Los modelos geo-estadísticos más usados se describen generalmente en función de parámetros, o constantes desconocidas, que deben ser estimados. En este trabajo proponemos el uso de técnicas no-paramétricas de suavizado para estimar el correlograma y el rango práctico (i.e. distancia entre observaciones a partir de la cual se considera que no existe correlación). Se ilustran estimaciones de modelos parámetricos (exponencial, esférico y gaussiano) y suavizados no-paramétricos (LOESS) sobre un conjunto de muestras de ADN geo-referenciadas en la microescala y genotipadas mediante múltiples marcadores moleculares del tipo microsatélite. El análisis geo-estadístico basado en distancias genéticas multivariadas obtenidas desde marcadores genéticos multilocus y multialélicos ha demostrado ser más sensible que el clásico análisis alelo a alelo para estudiar correlaciones en una escala espacial fina.