Estadística en la detección de QTLs usando mapeo por intervalos

ARROYO, A.; BRUNO, C.; BALZARINI, M.

Trelew, Chubut.

Congreso; XXXIV Congreso Argentino de Genética; 2005

Sociedad Argentina de Genética

Con el avance en visualización de ADN se encuentra una nueva dimensión (análisis de QTL) para la mejora genética de caracteres cuantitativos de importancia agronómica. Los QTL o loci de caracteres cuantitativos son regiones del genoma que se detectan sólo a través de probabilidades condicionales (probabilidad de observar un genotipo de QTL dado un genotipo del marcador); estas probabilidades dependen de la población de mapeo y de la distribución estadística del carácter. La estimación por máxima verosimilitud es la técnica más utilizada en el análisis de QTLs involucrando intervalos delimitados por marcadores. En las implementaciones actuales de software dicha estimación se basa en los supuestos del modelo lineal clásico (normalidad, independencia y homogeneidad de varianzas). A través del uso de modelos mixtos es posible relajar estos supuestos; por ejemplo, no sería necesario suponer que la variabilidad del carácter cuantitativo es la misma dentro de cada clase genotípica del QTL. En este trabajo se comparan modelos de análisis basadas en las funciones de verosimilitud (segregación conjunta del QTL y los marcadores que lo flanquean)asociadas a los modelos lineales clásicos y mixtos. Se ilustran ambas estrategias sobre una población obtenida por retrocruzamiento. Distintos niveles de heterogeneidad de varianzas entre clases genotípicas de QTL covarianza en la verosimilitud, en el marco de los modelos mixtos, no sólo permite obtener estimaciones más eficientes sino también libera al usuario dela necesidad de realizar suposiciones no realistas en la práctica.