Análisis gráfico de datos genéticos multidimensionales: árboles de mínimo recorrido

ARROYO, A.; BALZARINI, M.; BRUNO, C.; DI RIENZO, J.

Huerta Grande, Córdoba.

Congreso; XXXII Congreso Argentino de Genética, IV Jornadas Argentino-Chilenas de Genética y XXXIV Reunión Anual Sociedad de Genética de Chile; 2003

Sociedad Argentina de Genética y Sociedad Chilena de Genética

En estudios de colección de germoplasma es común realizar varias mediciones sobre numerosas accesiones y luego ordenar las accesiones en un espacio óptimo para interpretar la diversidad genética subyacente. Procedimientos multivariados tales como análisis de correspondencias, de componentes principales y de coordenadas principales son utilizados para la ordenación. Los resultados suelen visualizarse representando las accesiones en gráficos de dispersión según el valor que asumen sobre los dos ejes principales de ordenación o con gráficos biplot, donde se representan tanto las muestras (observaciones) como las características medidas (variables) en el mismo plano de ordenación. Dado que la dimensionalidad de las observaciones para cada accesión es igual al número de características relevadas, la dispersión de las accesiones en estos gráficos bidimensionales no necesariamente coincide con la diversidad en el espacio de mayor dimensión. Esta presentación ilustra, sobre varios conjuntos de datos, la implementación de árboles de recorrido mínimo (ARM) para confirmar interpretaciones en planos de ordenación. Los resultados demuestran que los ARM son útiles para visualizar asociaciones, para clasificar accesiones y que se vinculan directamente con el análisis de conglomerados por el método del vecino más cercano.