Modelos de Asociación multi-locus ara detectar resistência a podredumbre de espiga de maíz templado argentino

BRUNO CECILIA; MARÍA EUGENIA VIDELA; BARICALLA, AGUSTIN; IGLESIAS JULIANA

Salta

Congreso; XVII Reunión Cientifica del Grupo Argentino de Bioestadística; 2023

Grupo Argentino de Bioestadística

El maíz (Zea mays L.) se ve afectado por distintas enfermedades fúngicas, entre ellas, las podredumbres de espiga, ocasionadas por Fusarium verticillioides (FV), Fusarium graminearum (FG) y Ustilago maydis (UM). Estas enfermedades disminuyen el rendimiento de los granos al mismo tiempo que afectan la salud de personas y animales por la producción de micotoxinas perjudiciales. El mapeo de asociación de genoma completo (GWAS, del inglés Genome Wide Association Study) se basa en la asociación genotipo (SNP)-fenotipo y resulta eficaz para identificar QTL de resistencia. En este trabajo se evaluó la identificación de asociaciones a múltiples enfermedades causales de podredumbres de espiga en maíz a partir de modelos GWAS multilocus basados en modelos lineales mixtos (MLM) como Compresed MLM (CMLM) y Enriched CMLM (ECMLM). Se trabajó con una base de datos de 63 líneas estabilizadas de maíz genotipadas mediante 50K marcadores moleculares SNPs frecuentemente usadas para el mejoramiento en la Estación Experimental Agropecuaria (INTA) Pergamino. El conjunto de líneas genotipadas y fenotipadas para enfermedades de espiga evaluadas en el presente trabajo incluyen materiales de endosperma flint y dentado que han sido desarrollados localmente a partir de variedades nativas y/o germoplasma exótico. Además, se incluyeron líneas de referencia como B73 de genoma conocido. La relación de parentesco entre las líneas fue evaluada mediante dos metodologías bayesianas: STRUCTUCTUE y fastStTRUCTURE. Los resultados del agrupamiento fueron validados según el pedigree y la información de patrones heteróticos. A partir de los estudios de asociación realizados se obtuvieron cuatro segmentos cromosómicos candidatos para resistencia a FV, 10 para FG y siete para resistencia a UM. Se identificaron dos regiones asociadas a resistencia para las tres enfermedades.