INVESTIGADORES
MC CARTHY Cristina Beryl
congresos y reuniones científicas
Título:
Metagenoma de suelo del Distrito Fitogeográfico del Monte de Sierras y Bolsones (Provincia de Salta).
Autor/es:
JORGELINA MOREIRAS CLEMENTE; CHRISTINA B. MCCARTHY
Reunión:
Simposio; II Simposio Argentino de Jóvenes Investigadores en Bionformática 2017 (SAJIB17); 2017
Institución organizadora:
Regional Student Group of Argentina (RSG-Argentina)
Resumen:
Aunque muchas de las drogas farmacéuticas más importantes son producidas por la microbiota del suelo, el enfoque tradicional utilizado para caracterizar la capacidad biosintética de los microorganismos ambientales ha provisto muy poca información sobre este potencial. Algunos estudios recientes de microbiomas de suelo han revelado que la diversidad biosintética es vasta y está mayormente inexplorada. Más aún, los suelos áridos han mostrado la mayor biodiversidad. En este estudio caracterizamos el metagenoma de un suelo árido y prístino utilizando un enfoque metagenómico shotgun. Para esto, previamente se recolectó una muestra en el Distrito Fitogeográfico de Monte de Sierras y Bolsones (Departamento de Cafayate, Salta; S26°01.123´ W65°49.429´). El ADN total fue extraído y luego pirosecuenciado. Las lecturas fueron procesadas y ensambladas, obteniéndose un total de 45981 contigs. Se realizaron búsquedas por homología contra las bases de datos no redundantes proteica y nucloetídica del NCBI, y los resultados obtenidos se analizaron con MEGAN. De esta manera, se observó que el metagenoma está conformado por los Dominios Bacteria, Archaea y Eukaryota, y por Virus. El 76% de las secuencias mostraron homología con bacterias, principalmente con los filos Actinobacteria, Proteobacteria y Acidobacteria. El análisis funcional reveló que la mayoría de los contigs estaban relacionados con el metabolismo de carbohidratos y proteínas y, en menor proporción, con el metabolismo de nitrógeno, azufre y compuestos aromáticos, entre otros.Estos resultados proveen información acerca del posible efecto que tiene este tipo de ecosistema sobre la composición, diversidad y potencial biosintético del metagenoma de este suelo. Por otro lado, la caracterización funcional del metagenoma indicó que estaría asociado con el catabolismo de muchos contaminantes de suelo. Esto es de particular interés, dado que en la región de La Plata se encuentra una de las refinerías de petróleo más grandes del país.