EFICIENCIA DE LA SELECCIÓN GENÓMICA PARA MADURACIÓN TEMPRANA EN UNA POBLACIÓN DE MEJORAMIENTO DE CAÑA DE AZÚCAR

OSTENGO, SANTIAGO; RACEDO J.; BALZARINI, MONICA G.

Congreso; L Congreso Argentino de Genética y II Jornadas Regionales SAG-NEA; 2022

La selección genómica (SG) permite predecir el valor genético de los individuos mediante el uso simultáneo de marcadores moleculares generados a lo largo del genoma. La predicción del valor genético a partir de datos genómicos (GEBV) resulta de aplicar un modelo estadístico entrenado a partir de información moleculares y valores fenotípicos para un rasgo de interés. El objetivo de este trabajo fue analizar la eficiencia de la SG en una población de mejora compuesta por 88 individuos evaluados para la característica contenido de sacarosa (%) temprano, en 4 edades de corte, en dos localidades. La población fue genotipada con 1863 marcadores DArT dominantes. Se ajustaron los modelos de SG Bayes B, Bayesian Ridge Regression y Bayesian LASSO Regression. La eficiencia de la SG se evaluó mediante la correlación entre los valores de GEBVs y los BLUPs del efecto genotípico obtenidos desde los datos fenotípicos. Se usó un proceso de validación cruzada, usando porcentajes variables de número de individuos en población de entrenamiento y de prueba para obtener predicciones de GEBVs, que se repitieron 500 veces. Los resultados muestran que todos los modelos explicaron alta proporción de la variabilidad del mérito genético, aunque la eficiencia del SG fue baja (entre r=0.20 y r=0.25). Esto podría asociarse al escaso tamaño de la población de mejora y a la baja variabilidad genética del carácter maduración temprana en la población analizada. La implementación de los mismos modelos de SG en paneles de mayor tamaño y diversidad de genotipos podría arrojar mejores resultados.