INVESTIGADORES
URBIETA Maria Sofia
congresos y reuniones científicas
Título:
Análisis metagenómico de un consorcio arsénico-tolerante dominado por Acidithiobacillus spp. recuperado del Rio Agrio (Neuquén, Argentina).
Autor/es:
LIMA, A; URBIETA, M. S.; DONATI E.R.
Lugar:
Santiago de Chile
Reunión:
Congreso; XXIV Congreso Latinoamericano de Microbiología; 2018
Resumen:
El Rio Agrio recorre la zona geotermal Caviahue-Copahue constituyendo un ambiente extremo natural caracterizado por aguas ácidas con alto contenido de azufre y hierro, como con presencia de arsénico. Las condiciones descritas convierten a este ambiente en una importante fuente de microorganismos extremófilos potencialmente valiosos en aplicaciones biotecnológicas industriales y ambientales. Este es el caso de las bacterias acidófilas, azufre y/o hierro oxidantes del género Acidithiobacillus, cuyo uso en biolixiviación es ampliamente reconocido. En función de las características de este ambiente se prospectaron muestras del río, específicamente de Salto del Agrio, en busca de consorcios microbianos acidófilos y arsénico-tolerantes, con presencia de representantes del género Acidithiobacillus.Las muestras obtenidas se sometieron a enriquecimientos en medio MAC pH3,suplementado con S° y cantidades crecientes de As(III) (hasta 15 mM) a 30°C. Elmetagenoma del consorcio seleccionado mostró una baja diversidad específica condominancia de bacterias del género Acidithiobacillus spp., las cuales constituyen un 82% del total de las secuencias obtenidas. La asignación taxonómica de los representantes del complejo específico Acidithiobacillus se reevaluó empleando bases de datos curadas privadas y estrategias bioinformáticas que logran mayores niveles de resolución, en base a: 1) el oligotipado de las secuencias recuperadas del gen 16S rRNA y 2) el análisis de los perfiles de polimorfismos únicos de secuencia en múltiples genes housekeeping. Según éstos, las principales especies representadas en la muestra fueron los hierro-oxidantes A. ferrooxidans (73.8% coverage), A. ferridurans (68.7%coverage) y A. ferrivorans (40.1% coverage). El ordenamiento de los contigs contra cepas de referencia permitió recuperar el genoma borrador de la especie mayoritaria y segmentos parciales de las otras dos. El genoma derivado de metagenoma (MGDG) de A. ferrooxidans presenta un %G+C de 59.2, un tamaño de 3.0 Mbp y una identidad nucleotídica promedio (ANI) de 95.6% vs. la cepa ATCC23270, que da cuenta de la divergencia genómica entre ambas. Empleando este draft genome y estrategias de reconstrucción metabólica se analizó la respuesta de tolerancia a arsénico del taxón dominante. Los resultados obtenidos se discuten en el contexto de la respuesta de tolerancia a arsénico descrita con anterioridad para este taxón