Integración y minería de datos en bioinformática

GERARD M.

Santa Fe

Seminario; Seminarios PAE-CELTIC 2009; 2010

UTN-FRSF, UNL-FICH, INGAR, INTEC

Un problema de actual interés económico para la agrobiotecnología consiste en detectar la presencia de genes y metabolitos relacionados por los mismos mecanismos regulatorios. En particular la integración de datos transcriptómicos y metabolómicos de plantas, puede ser usado para identificar cambios fenotípicos silenciosos asociados a vías metabólicas. Por lo tanto, determinar la relación entre genes, proteínas y reacciones es una tarea no trivial y de especial interés para la reconstrucción de una red metabólica, la cual podría intervenir en la obtención de un producto final con una determinada característica. En este trabajo se presentan los resultados alcanzados en la detección de relaciones ocultas en datos metabólicos y transcripcionales empleando un nuevo algoritmo basado en mapas auto-organizados y la comparación de éste con las técnicas de agrupamiento jerárquico y k-medias. Además se introduce la propuesta de un algoritmo genético para encontrar relaciones entre compuestos metabólicos en un agrupamiento.