Caracterización del gen zds en trigo candeal en materiales contrastantes en el contenido de pigmentos carotenoides

CAMARGO ACOSTA, E.; GARBUS, I; RONCALLO, P.; DIAZ, A. R.; ECHENIQUE, V

Congreso; Congreso Latinoamericano de Genetica; 2012

El trigo candeal se constituye como materia prima en la producción de pastas. Un carácter de calidad importante es el color amarillo de su sémola, dado principalmente por el contenido de pigmentos carotenoides en el grano (CPCG). Este carácter es de tipo cuantitativo, altamente heredable, poligénico y su expresión depende de la interacción genotipo-ambiente. Hemos investigado alelos del gen de la enzima de la ruta de  biosíntesis de carotenoides Zeta Caroteno Desaturasa (Zds) en cuatro genotipos contrastantes para el CPCG (Kofa y B.Topacio vs UC1113 y B.I.Cumenay). Para ello, fueron diseñados cebadores basados en un EST de Zds  de trigo pan (FJ169496.1) con los que se amplificaron secuencias en los cuatro materiales, que fueron clonadas y secuenciadas. Usando los cebadores ZDS3F/3R se obtuvieron cuatro clones que correspondieron a una única secuencia de 1009 pb, constituida por dos intrones y tres exones, con 96% de identidad con los alelos ZDSA1 y ZDS D1 de trigo pan y una deleción de XX bp con respecto al primero. Los 16 clones obtenidos con los cebadores ZDS4F/5R generaron una secuencia de 1368pb, formada por tres intrones y cuatro exones con 99% identidad con ZDSA1 y 98% con ZDSD1 y una deleción de 200 bp con respecto a ZDSD1. Estos resultados sugieren la existencia de un único alelo en los materiales de candeal analizados. La presencia de deleciones y la mayor identidad entre zdsA1 y zdsD1 (98%) respecto de la secuencia obtenida con los cebadores ZDS3F/3R, sugieren que la secuencia identificada no correspondería al genoma A, sino probablemente al B de trigo candeal