Estudio de la diversidad bacteriana en rizosfera de Poaceae a distintas alturas mediante análisis por DGGE

DURAN, M.A; ESTÉVEZ MC; FERRERO M; MENOYO E; LUGO MA

Congreso; V Congreso nacional de estudiantes de bioquímica y biotecnología; 2007

La rizosfera se define como el volumen de suelo adyacente la raíz de la planta. Los exudados radicales estimulan el crecimiento de poblaciones microbianas y a su vez, estos . microorganismos rizosféricos ejercen fuertes efectos sobre el crecimiento y salud del vegetal por la solubilizacion de nutrientes, la fijación del N2, o la producción de las hormonas vegetales. La mayoría de los estudios de diversidad bacteriana de la rizosfera fueron realizados usando las clásicas técnicas basadas en el cultivo de los microorganismos por lo que solo una pequeña proporción de las poblaciones puede ser identificada, dejando de lado muchas veces las bacterias con potencial interés biotecnológico. Por esta razón el objetivo de este trabajo fue el estudio de la diversidad de bacterias asociada a la rizosfera por medio de la amplificación del gen del ARNr 16S y posterior análisis en geles de DGGE. La zona de muestreo se ubica en la Puna Argentina, en las provincias de Jujuy y Salta. Las muestras de tierra rizosférica corresponden a una especie de planta de la familia Poaceae tomadas a diferentes alturas: 3449, 3571 Y 3779 m.s.n.rn. Se realizaron enriquecimientos de las muestras de tierra en medio LB y posterior extracción de ADN de estos enriquecimientos y directamente de las muestras de suelo. Con la amplificación de estos templados se realizó la electroforesis. Los patrones de bandas se compararon entre las distintos muestreos y bandas predominantes fueron recortadas, reamplificadas y secuenciadas con el fin de identificar los bacterias componentes de la población. También en las muestras de tierra se determinó la concentración de bacterias heterótrofas totales mediante recuento en placa de diluciones seriadas de las muestras. Los promedios en el recuento de bacterias heterótrofas fueron: a 3449 msnm: 3,24E+03 UFC/gr., a 3571 msnm: 5,43E+03 UFC/g. y a 3779.msnm: 5,53E+03 UFC/gr. Estos revelan un aumento de la población bacteriana a las mayores altitudes, respecto de la altura más baja de muestreo. El análisis de los geles de DGGE evidencia un aumento de la riqueza de bandas que se correspondieron con secuencias bacterianas distintas. Un análisis del número de OTUs o taxones, permitió encontrar 9 y 10 taxones diferentes a 3571 y 3779 m.s.n.m, respectivamente y 6 taxones diferentes a 3449 m.s.n.rn." En todas las muestras, se obtuvieron bandas correspondientes a secuencias del género Bacillus, mientras que a 3571 y 3779 m.s.n.m fueron predominantes las bandas correspondientes a los grupos bacterianos: Bacillus, RhízobíumlAgrobacferium, Sphíngomonas., Burkholde,ria, Cupriavídus y Gordonia ..