IDENTIFICACION DE RETROELEMENTOS TIPO LTR IN SILICO Y SU DISTRIBUCION CROMOSOMICA EN Capsicum annuum

YAÑEZ ANAHÍ; PAZ ROSALIA CRISTINA; NATALIA PILAR ANDINO; JUAN URDAMPILLETA

Mendoza

Congreso; XXXVI Jornadas Argentinas de Botánica; 2017

Sociedad Argentina de Botánica

Pimiento (Capsicumannuum) es una hortaliza perteneciente a la familia de las Solanáceas degran valor económico y que cuenta con un gran número de cultivares comercialesy silvestres. Una gran porción del genoma de esta especie está constituida por retroelementosdel orden LTR (del inglés, Long Terminal Repeats) con un potencial uso comomarcadores moleculares para distinguir variedades. En trabajos bioinformáticosanteriores sobre el genoma de referencia de C.annuum cv. Zunla, hemosidentificado 1235 retroelementos completos e intactos, de los cuales solamente 3familias representan aproximadamente el 60% de los retroelementos detectados:GypsyZla_13 (6,2%), CopiaZla_01 (8,8%) y GypsyZla_16 (45,7%), perteneciente alos clados Del/Tekay, Retrofit/Ale y Athila respectivamente. El análisis de secuencias permitió eldiseño de cebadores específicos sobre las regionescodificantes RT y RH. Los fragmentos amplificados por PCR, clonados ysecuenciados, se utilizaron como sondas específicas en métodos de hibridaciónin situ fluorescente (FISH). Con el fin de comparar la distribución yabundancia relativa de estas familias dentro del genoma C. annuum, las mismas fueron utilizadas para comparar ycaracterizar diferentes cultivares de pimiento comerciales y silvestres. Nuestrosresultados sugieren que existe una distribución diferencial de dichos retroelementosentre los cultivares evaluados.Financiamiento: D-TEC0008/13 (AGENCIA, MINCyT, Argentina). PROJOVI 2015 (UNSJ)