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La presencia de virus en aguas contaminadas con materia fecal es un problema de salud pública a nivel mundial. Numerosos brotes de gastroenteritis de origen viral han sido reportados por contacto con aguas contaminadas, detectando frecuentemente la presencia de rotavirus (RV) y norovirus (NoV) en los mismos. El río Suquía, nace en el Embalse San Roque y recorre la ciudad de Córdoba integrándose al paisaje y a las actividades recreativas. Estudios previos realizados en nuestro laboratorio demostraron la presencia de enterovirus viable en dos puntos de río, localizados en las cercanías de la planta depuradora de efluentes cloacales de la ciudad. Con el fin de profundizar el conocimiento acerca de la calidad virológica de las aguas del Suquía nos propusimos: i) analizar la presencia de RV y NoV en aguas del río y caracterizar las variantes virales detectadas, y ii) conocer el patrón de circulación de RV y NoV en la población de Córdoba, a través del análisis de aguas residuales, con el objeto de comparar las cepas virales que circulan en la población local con aquellas detectadas en las aguas recreacionales. Para esto, durante el año 2010 se colectaron estacionalmente muestras de aguas en ocho puntos del río Suquía (excepto en primavera, que no pudo realizarse el muestreo en un sitio; n=31), seleccionados con especial interés en zonas utilizadas con fines recreacionales, y mensualmente se tomaron muestras de aguas residuales (n=12) a partir del caño principal de la planta depuradora de efluentes cloacales de la ciudad de Córdoba. Las muestras de agua fueron concentradas 100X a través de centrifugación y precipitación con polietilenglicol. La detección y caracterización de RV y NoV se realizó mediante RT-PCR/nested PCR con primers dirigidos a las proteínas VP4 y VP7 de la cápside externa de RV y al gen de la polimerasa de NoV. El análisis de virus en aguas del río Suquía reveló la presencia de RV y NoV en el 100% y 83.9% (26/31) de las muestras analizadas, respectivamente. Los genotipos de RV identificados en las aguas superficiales fueron G1P[8] (22/31), G3P[8] (16/31), G9P[8] (13/31), G4P[8] (8/31), G2P[4] (2/31) y G8P[8] (1/31) y los genogrupos de NoV detectados fueron GII (23/31) y GI (13/31). El monitoreo de estos agentes virales en las muestras cloacales demostró la circulación continua de ambos virus en la población local. Se detectaron los genotipos de RV G2P[4] (8/12), G1P[8] (6/12), G9P[8] (5/12) y G3P[8] (1/12), y los genogrupos de NoV GII (7/12) y GI (1/12). La información obtenida reveló que la presencia de RV y NoV es un evento frecuente en las aguas de río analizadas, por lo que el río Suquía podría tener un rol en la diseminación de estos agentes virales en el ambiente. Las variantes genéticas de RV y NoV detectadas en las aguas superficiales coinciden con las que producen infección en individuos susceptibles, por lo que esta información enfatiza la importancia de establecer futuros parámetros virales en la evaluación de la calidad del agua.

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