Epidemiología Basada en Aguas Residuales: tendencia de circulación de SARS-CoV-2 y variantes de preocupación en la Ciudad de Córdoba y Valle de Punilla, Córdoba, Argentina.

MASACHESSI GISELA

Córdoba

Congreso; Primer congreso Provincial de Infectología; 2021

El virus SARS-CoV-2 es excretado por materia fecal en el 35% de los individuos infectados (sintomáticos y asintomáticos) hasta aproximadamente tres semanas de iniciados los síntomas), tomando como valor medio de excreción 17 días, independientemente a la presencia o no de diarrea. Por tanto, las aguas residuales, son una matriz que resume la excreción poblacional del virus. Objetivo: Estudiar la dinámica de circulación poblacional de SARS-CoV-2 y sus variantes de preocupación en aguas residuales de la Ciudad de Córdoba Capital y Valle de Punilla. Materiales y Métodos: Desde mayo 2020 al presente, se recolectaron 261 muestras de aguas residuales crudas del conducto de la red central que ingresa a la planta depuradora de la ciudad de Córdoba y a las plantas de Carlos Paz, Valle Hermoso y La Falda, en Valle de Punilla. Frecuencia de recolección: semanal. Concentración del virus en aguas residuales: elusión y precipitación con polietilenglicol 6000. Extracción de ARN: MagNAPure 96- Roche. Detección genómica: DisCoVery SARS-CoV-2RT-PCR Detection Kit gen N y LightMix® Modular SARS and Wuhan CoV E-gene kit. Detección de variantes por RT-PCR en tiempo real: TaqMan™ SARSCoV-2 Mutation Panel (AppliedBiosystems) para detección de VOCs Alpha, Beta, Gamma y Delta. Resultados y Conclusiones: Del total de muestras; el 29,1% se analizó para la detección del Gen N y el 70,9% se analizaron para la detección de los genes N y E del virus. Del total de muestras analizadas para ambos genes (n = 185), el 34,1% fueron positivas para ambos genes; el 24,8% fueron positivas solo para el gen N y el 41,1% solo para el gen E. La detección del genoma de SARS-CoV-2 acompañó la curva epidemiológica de casos clínicos reportados, siendo detectado en Córdoba Capital hasta dos semanas antes del aumento exponencial de casos clínicos. El estudio de las aguas residuales describió también la dinámica de circulación de las variantes virales VOCs en las localidades estudiadas. La detección combinada de los genes N y E del SARS-CoV-2 es una herramienta valiosa para la vigilancia de COVID-19, que informa sobre la circulación viral a lo largo de las fases de la curva epidémica en la Provincia de Córdoba