Characterization and mapping of durum wheat lipoxygenases

SORESI DANIELA; CARRERA ALICIA; ROMERO JOSÉ; RONCALLO PABLO F.; ECHENIQUE VIVIANA; GARBUS INGRID

Santiago, Chile

Congreso; XIV CONGRESO LATINOAMERICANO DE GENÉTICA (ALAG); 2010

Asociación Latinoamericana de Genética (ALAG)

La localización genética de los genes de lipoxigenasas (Lpx) y su rol en el color de la pasta y sémola de trigo candeal (Triticum durum) han sido estudiados por nuestro grupo de trabajo. Presentamos los avances respecto de la localización genómica de los genes Lpx. Previamente mostramos que el locus Lpx-1 está duplicado en el genoma B (Lpx-B1.1 y Lpx-B1.2), y que la cantidad de copias del gen se relaciona con el nivel de actividad LPX. Un nuevo marcador para el gen Lpx1, polimórfico entre UC1113 y Kofa, fue mapeado en la población de 94 RILs, derivada de estos progenitores. El amplicón, de 1124 bp, corresponde a una región contigua a la reportada (DQ474241), permitiendo la anotación de la secuencia exón 3 - exón 8. Este marcador posibilita amplificaciones más reproducibles que las obtenidas con el utilizado previamente. Paralelamente, se mapeó en la población de RILs, el pseudogen Lpx-A1_like (Garbus et al., 2009) en el brazo corto del cromosoma 4A, entre los microsatélites gwm192b y LoxB. Dicha región sería homóloga a la del cromosoma 4B, en la que se localiza LpxB1.1. Además, establecimos que en el genoma A de UC1113 existen dos copias delecionadas del gen Lpx1, mientras que sólo una fue detectada en Kofa. Coincidentemente, no han sido reportados QTLs de actividad LPX en el cromosoma 4A. Ensayos en Urartu, diploide dador del genoma A, ayudarán a una mejor comprensión de la evolución de esta familia de genes Triticum durum) han sido estudiados por nuestro grupo de trabajo. Presentamos los avances respecto de la localización genómica de los genes Lpx. Previamente mostramos que el locus Lpx-1 está duplicado en el genoma B (Lpx-B1.1 y Lpx-B1.2), y que la cantidad de copias del gen se relaciona con el nivel de actividad LPX. Un nuevo marcador para el gen Lpx1, polimórfico entre UC1113 y Kofa, fue mapeado en la población de 94 RILs, derivada de estos progenitores. El amplicón, de 1124 bp, corresponde a una región contigua a la reportada (DQ474241), permitiendo la anotación de la secuencia exón 3 - exón 8. Este marcador posibilita amplificaciones más reproducibles que las obtenidas con el utilizado previamente. Paralelamente, se mapeó en la población de RILs, el pseudogen Lpx-A1_like (Garbus et al., 2009) en el brazo corto del cromosoma 4A, entre los microsatélites gwm192b y LoxB. Dicha región sería homóloga a la del cromosoma 4B, en la que se localiza LpxB1.1. Además, establecimos que en el genoma A de UC1113 existen dos copias delecionadas del gen Lpx1, mientras que sólo una fue detectada en Kofa. Coincidentemente, no han sido reportados QTLs de actividad LPX en el cromosoma 4A. Ensayos en Urartu, diploide dador del genoma A, ayudarán a una mejor comprensión de la evolución de esta familia de genes